More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3075 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  100 
 
 		 657 aa  1342    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  64.15 
 
 		 660 aa  850    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  63.51 
 
 		 654 aa  868    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  51.22 
 
 		 656 aa  671    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  81.74 
 
 		 657 aa  1130    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  68.1 
 
 		 657 aa  909    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  59.82 
 
 		 662 aa  814    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  62.01 
 
 		 657 aa  846    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  42.63 
 
 		 703 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  43.08 
 
 		 586 aa  449  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  39.38 
 
 		 708 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  39.81 
 
 		 690 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  39.49 
 
 		 705 aa  434  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.79 
 
 		 654 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.86 
 
 		 708 aa  422  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  38.07 
 
 		 711 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  38.23 
 
 		 671 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.15 
 
 		 675 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  37.85 
 
 		 695 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  36.31 
 
 		 713 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  41.05 
 
 		 729 aa  419  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.15 
 
 		 675 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  39.55 
 
 		 675 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  38.66 
 
 		 682 aa  412  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.9 
 
 		 710 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  40.71 
 
 		 631 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  37.62 
 
 		 675 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  36.03 
 
 		 740 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.34 
 
 		 644 aa  395  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.61 
 
 		 582 aa  393  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.82 
 
 		 570 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.4 
 
 		 645 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  38.21 
 
 		 649 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.83 
 
 		 704 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.87 
 
 		 672 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  39.05 
 
 		 582 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  35.4 
 
 		 708 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.38 
 
 		 680 aa  372  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  37.28 
 
 		 594 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  37.28 
 
 		 594 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  39.17 
 
 		 552 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  37.61 
 
 		 594 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  37.28 
 
 		 594 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  37.28 
 
 		 594 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  37 
 
 		 596 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  39.17 
 
 		 548 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  34.3 
 
 		 719 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  38.18 
 
 		 638 aa  367  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  37.28 
 
 		 594 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  37.28 
 
 		 594 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  37.7 
 
 		 632 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  37.7 
 
 		 632 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  37.7 
 
 		 632 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  35.29 
 
 		 723 aa  363  4e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  37.23 
 
 		 618 aa  363  6e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  37.08 
 
 		 630 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  38.32 
 
 		 583 aa  362  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.69 
 
 		 670 aa  360  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  37.13 
 
 		 631 aa  360  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  37.08 
 
 		 630 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  36.53 
 
 		 644 aa  360  4e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  37.59 
 
 		 553 aa  355  1e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  37.41 
 
 		 553 aa  354  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  35.9 
 
 		 646 aa  353  7e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  37.48 
 
 		 727 aa  353  8e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  36.46 
 
 		 583 aa  352  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  38.78 
 
 		 670 aa  352  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  36.64 
 
 		 584 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.64 
 
 		 584 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  36.64 
 
 		 584 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  36.64 
 
 		 584 aa  351  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  37.65 
 
 		 595 aa  350  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  38 
 
 		 578 aa  350  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.36 
 
 		 582 aa  349  8e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.6 
 
 		 689 aa  349  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  36.46 
 
 		 583 aa  349  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  36.03 
 
 		 578 aa  348  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  35.81 
 
 		 577 aa  348  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  36.46 
 
 		 583 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  36.46 
 
 		 583 aa  348  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.76 
 
 		 577 aa  347  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  36.76 
 
 		 577 aa  347  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  37.44 
 
 		 577 aa  347  6e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  35.93 
 
 		 578 aa  345  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  35.81 
 
 		 578 aa  346  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  36.38 
 
 		 580 aa  345  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.48 
 
 		 595 aa  345  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  35.26 
 
 		 578 aa  345  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  32.45 
 
 		 734 aa  345  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.48 
 
 		 595 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  36.28 
 
 		 583 aa  343  5e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  36.49 
 
 		 613 aa  341  2e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  37.07 
 
 		 624 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  36.18 
 
 		 582 aa  340  5e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  36.31 
 
 		 613 aa  339  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 684 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  35.79 
 
 		 578 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  37.98 
 
 		 605 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  32.44 
 
 		 721 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.45 
 
 		 692 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>