More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0740 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
645 aa  1318    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.98 
 
 
644 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  46.17 
 
 
675 aa  554  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.39 
 
 
654 aa  552  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  43.96 
 
 
690 aa  532  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.31 
 
 
710 aa  531  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.19 
 
 
654 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.27 
 
 
662 aa  405  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  39.02 
 
 
656 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.31 
 
 
657 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  37.4 
 
 
657 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  37.92 
 
 
660 aa  392  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  37.6 
 
 
657 aa  391  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  38.03 
 
 
657 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  37.55 
 
 
586 aa  373  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.65 
 
 
703 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  37.58 
 
 
708 aa  349  9e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  34.52 
 
 
631 aa  337  2.9999999999999997e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.5 
 
 
570 aa  331  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  35.81 
 
 
705 aa  330  4e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  33.9 
 
 
695 aa  326  9e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.85 
 
 
582 aa  322  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  36.22 
 
 
577 aa  320  5e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  35.92 
 
 
582 aa  319  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  35.96 
 
 
585 aa  319  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1980  peptidoglycan synthetase FtsI  34.74 
 
 
581 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0756202  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1976  peptidoglycan synthetase FtsI  34.74 
 
 
581 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0049201  normal  0.138464 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2037  peptidoglycan synthetase FtsI  34.74 
 
 
581 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00133127  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  34.97 
 
 
583 aa  318  3e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1479  peptidoglycan synthetase FtsI  34.74 
 
 
581 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0193532  normal  0.796051 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1295  peptidoglycan synthetase FtsI  34.56 
 
 
581 aa  316  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  38.45 
 
 
671 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.29 
 
 
594 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  36.29 
 
 
594 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.54 
 
 
588 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  34.8 
 
 
577 aa  315  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  35.06 
 
 
586 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  35.79 
 
 
638 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  33.64 
 
 
713 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.72 
 
 
675 aa  313  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  34.62 
 
 
588 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  34.62 
 
 
588 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000490417 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  36.13 
 
 
587 aa  311  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  34.62 
 
 
588 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  34.62 
 
 
588 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  33.57 
 
 
578 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  35.61 
 
 
729 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  34.62 
 
 
588 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.46 
 
 
675 aa  310  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  35.71 
 
 
570 aa  310  6.999999999999999e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  36.46 
 
 
675 aa  309  8e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  37.03 
 
 
578 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00085  transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 3)  34.95 
 
 
588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3516  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.95 
 
 
588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0090  peptidoglycan synthetase FtsI  34.95 
 
 
588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0086  peptidoglycan synthetase FtsI  34.95 
 
 
588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.67693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00084  hypothetical protein  34.95 
 
 
588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0077  peptidoglycan synthetase FtsI  34.95 
 
 
588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0089  peptidoglycan synthetase FtsI  34.95 
 
 
588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679095  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0092  peptidoglycan synthetase FtsI  34.95 
 
 
588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.948544 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3573  peptidoglycan glycosyltransferase  34.95 
 
 
588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.01 
 
 
571 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  34.55 
 
 
708 aa  306  7e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  33.49 
 
 
740 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  33.58 
 
 
587 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0630  peptidoglycan synthetase FtsI  35.41 
 
 
588 aa  304  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  36.38 
 
 
579 aa  304  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  34.13 
 
 
578 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  34.83 
 
 
580 aa  304  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  34.57 
 
 
597 aa  304  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  33.7 
 
 
607 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  32.42 
 
 
719 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.9 
 
 
607 aa  303  5.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.58 
 
 
621 aa  302  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  34.31 
 
 
582 aa  301  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.31 
 
 
582 aa  301  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  34.86 
 
 
590 aa  301  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  33.4 
 
 
621 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  33.89 
 
 
578 aa  300  4e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  33.58 
 
 
624 aa  300  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0352  peptidoglycan synthetase FtsI  35.79 
 
 
599 aa  300  6e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  34.08 
 
 
615 aa  300  7e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.9 
 
 
689 aa  299  8e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  34.08 
 
 
615 aa  300  8e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3786  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
587 aa  299  8e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  34.08 
 
 
615 aa  300  8e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 
578 aa  299  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  33.7 
 
 
578 aa  299  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  34.71 
 
 
578 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  34.01 
 
 
601 aa  298  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.33 
 
 
680 aa  298  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  34.76 
 
 
583 aa  298  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  34.51 
 
 
594 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  34.48 
 
 
575 aa  298  3e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  34.57 
 
 
583 aa  297  4e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  34.39 
 
 
596 aa  297  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  34.33 
 
 
594 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  34.33 
 
 
594 aa  297  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  34.33 
 
 
594 aa  297  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  34.09 
 
 
632 aa  297  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>