More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08800 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_08800  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  100 
 
 
557 aa  1131    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000196168 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09550  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  50.18 
 
 
581 aa  556  1e-157  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.102088 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2101  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.4 
 
 
633 aa  503  1e-141  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277912 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0480  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.45 
 
 
574 aa  354  2.9999999999999997e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  32.96 
 
 
708 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.08 
 
 
582 aa  288  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  30.4 
 
 
695 aa  281  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.16 
 
 
607 aa  279  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  32.69 
 
 
711 aa  274  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  33.09 
 
 
729 aa  272  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  31.44 
 
 
705 aa  271  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16620  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.68 
 
 
663 aa  271  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.422305  normal  0.0185219 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.09 
 
 
644 aa  269  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.53 
 
 
704 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  30.71 
 
 
713 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.36 
 
 
662 aa  260  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  32.73 
 
 
646 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  33.77 
 
 
644 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  31.03 
 
 
638 aa  258  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  31.6 
 
 
670 aa  257  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  31.16 
 
 
719 aa  257  5e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  29.84 
 
 
740 aa  256  6e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  31.69 
 
 
839 aa  256  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  30.99 
 
 
727 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.18 
 
 
581 aa  254  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  29.78 
 
 
657 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  31.73 
 
 
653 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  31.05 
 
 
645 aa  253  5.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.02 
 
 
702 aa  253  9.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.32 
 
 
635 aa  252  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.07 
 
 
716 aa  252  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.97 
 
 
754 aa  252  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  31.5 
 
 
578 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  30.51 
 
 
579 aa  251  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.78 
 
 
657 aa  250  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.8 
 
 
637 aa  250  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  30.31 
 
 
622 aa  249  8e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  33.86 
 
 
578 aa  249  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.77 
 
 
654 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.86 
 
 
619 aa  249  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  31.32 
 
 
582 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  30.62 
 
 
716 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  31.32 
 
 
583 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  29.72 
 
 
657 aa  247  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  31.94 
 
 
708 aa  246  6e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  30.85 
 
 
582 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  30.49 
 
 
631 aa  246  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  31.49 
 
 
734 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  33 
 
 
578 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.09 
 
 
570 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  30.34 
 
 
723 aa  244  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  30.83 
 
 
579 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  31.94 
 
 
586 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  30.83 
 
 
579 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.93 
 
 
677 aa  243  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  30.16 
 
 
580 aa  243  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  29.95 
 
 
682 aa  243  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.95 
 
 
645 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.38 
 
 
553 aa  242  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  31.84 
 
 
690 aa  242  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  32.97 
 
 
578 aa  241  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1068  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.9 
 
 
579 aa  240  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3069  peptidoglycan glycosyltransferase  32.35 
 
 
586 aa  241  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0109625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  30.48 
 
 
656 aa  240  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.64 
 
 
710 aa  240  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  31.85 
 
 
578 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  30.8 
 
 
576 aa  239  8e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  29.79 
 
 
613 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  31.25 
 
 
660 aa  238  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2652  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.39 
 
 
654 aa  237  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  29.6 
 
 
613 aa  237  4e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.66 
 
 
670 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2968  penicillin-binding protein 3A  30.47 
 
 
565 aa  236  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 
649 aa  236  8e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  32.46 
 
 
581 aa  236  9e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  30.7 
 
 
570 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  30.8 
 
 
575 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.28 
 
 
634 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  29.94 
 
 
575 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  30.84 
 
 
553 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  32.61 
 
 
578 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35190  penicillin-binding protein 3A  30.11 
 
 
565 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.38 
 
 
680 aa  233  7.000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  30.84 
 
 
575 aa  232  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 
692 aa  232  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  30.5 
 
 
675 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.98 
 
 
635 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  31 
 
 
586 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  33.6 
 
 
583 aa  231  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  31.27 
 
 
583 aa  231  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.86 
 
 
594 aa  231  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.16 
 
 
655 aa  230  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  30.86 
 
 
594 aa  231  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.38 
 
 
654 aa  231  4e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.4 
 
 
618 aa  230  6e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  30.18 
 
 
635 aa  230  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  30.45 
 
 
728 aa  230  7e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  30.63 
 
 
585 aa  229  7e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  30.52 
 
 
568 aa  229  8e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  30.27 
 
 
721 aa  229  8e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>