More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3205 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 635 aa  1269    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  43.82 
 
 		 638 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  42.76 
 
 		 727 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  42.42 
 
 		 653 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.46 
 
 		 702 aa  438  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.07 
 
 		 618 aa  433  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.81 
 
 		 692 aa  428  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16620  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  42.52 
 
 		 663 aa  422  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.422305  normal  0.0185219 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  42.55 
 
 		 754 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1068  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.89 
 
 		 579 aa  414  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  42.66 
 
 		 839 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  42.4 
 
 		 670 aa  411  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.13 
 
 		 583 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1656  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.06 
 
 		 682 aa  408  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  42.48 
 
 		 581 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.44 
 
 		 655 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1565  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.09 
 
 		 600 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3069  peptidoglycan glycosyltransferase  38.24 
 
 		 586 aa  360  5e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0109625  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1564  peptidoglycan glycosyltransferase  36.42 
 
 		 600 aa  352  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.924242  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2416  Peptidoglycan glycosyltransferase  40 
 
 		 584 aa  347  5e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.47 
 
 		 607 aa  334  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.86 
 
 		 677 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2100  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.8 
 
 		 568 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000215244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.17 
 
 		 637 aa  303  7.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.8 
 
 		 635 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1107  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  31.38 
 
 		 613 aa  291  3e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.51 
 
 		 716 aa  288  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0175  cell division protein  33.51 
 
 		 600 aa  286  8e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13660  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.69 
 
 		 608 aa  283  7.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00924315  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  32.59 
 
 		 635 aa  277  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.89 
 
 		 634 aa  273  9e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  31.71 
 
 		 657 aa  270  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.48 
 
 		 553 aa  269  8.999999999999999e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.16 
 
 		 657 aa  266  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  33.17 
 
 		 577 aa  265  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  33.17 
 
 		 656 aa  263  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  31.39 
 
 		 679 aa  263  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  29.97 
 
 		 695 aa  263  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  31.17 
 
 		 652 aa  262  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1250  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.17 
 
 		 592 aa  259  8e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0497738  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.37 
 
 		 662 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  33 
 
 		 556 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3262  peptidoglycan glycosyltransferase  30.71 
 
 		 642 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3273  peptidoglycan glycosyltransferase  30.71 
 
 		 642 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709571  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  30.71 
 
 		 642 aa  253  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 		 716 aa  252  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  30.94 
 
 		 708 aa  252  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  31.48 
 
 		 705 aa  251  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.3 
 
 		 654 aa  250  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  30.4 
 
 		 657 aa  249  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3930  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.16 
 
 		 570 aa  248  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000459011  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.55 
 
 		 582 aa  248  4e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  30.16 
 
 		 660 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  30.72 
 
 		 719 aa  242  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2652  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.58 
 
 		 654 aa  241  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  31.98 
 
 		 579 aa  239  8e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.75 
 
 		 672 aa  239  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  31.37 
 
 		 711 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  30.31 
 
 		 583 aa  236  7e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.97 
 
 		 654 aa  236  8e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.54 
 
 		 689 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.91 
 
 		 704 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  31.76 
 
 		 582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  31.58 
 
 		 582 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  31.11 
 
 		 587 aa  235  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.78 
 
 		 588 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09550  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.8 
 
 		 581 aa  234  3e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.102088 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.88 
 
 		 619 aa  234  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  32.35 
 
 		 582 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.35 
 
 		 582 aa  234  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.01 
 
 		 645 aa  233  6e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  30.41 
 
 		 682 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  30.32 
 
 		 721 aa  233  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  30.12 
 
 		 586 aa  233  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  30.87 
 
 		 548 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  30.87 
 
 		 552 aa  232  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  31.09 
 
 		 614 aa  231  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  31.92 
 
 		 601 aa  231  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.5 
 
 		 570 aa  231  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  31.83 
 
 		 581 aa  230  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  29.55 
 
 		 728 aa  230  6e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 		 690 aa  230  7e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  30.7 
 
 		 729 aa  229  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  29.76 
 
 		 586 aa  229  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.27 
 
 		 703 aa  229  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1886  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.03 
 
 		 736 aa  228  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  31.3 
 
 		 597 aa  228  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  29.71 
 
 		 657 aa  228  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  31.24 
 
 		 607 aa  228  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 		 680 aa  227  4e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  30.82 
 
 		 577 aa  226  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.74 
 
 		 708 aa  226  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  28.3 
 
 		 713 aa  226  9e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  29.19 
 
 		 594 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  29.19 
 
 		 594 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  29.19 
 
 		 594 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  29.19 
 
 		 594 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  32.47 
 
 		 553 aa  225  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  32.47 
 
 		 553 aa  225  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  32.12 
 
 		 580 aa  225  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>