More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2982 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2652  Peptidoglycan glycosyltransferase  58.88 
 
 
654 aa  705    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
635 aa  1288    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3262  peptidoglycan glycosyltransferase  83.84 
 
 
642 aa  1073    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258403  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  79.06 
 
 
679 aa  997    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3273  peptidoglycan glycosyltransferase  83.84 
 
 
642 aa  1073    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709571  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  58.63 
 
 
634 aa  699    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  83.84 
 
 
642 aa  1073    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  91.68 
 
 
652 aa  1173    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.14 
 
 
635 aa  551  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  45.84 
 
 
637 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3930  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.75 
 
 
570 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000459011  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.52 
 
 
607 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  37.82 
 
 
638 aa  359  7e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  38.22 
 
 
727 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  37.48 
 
 
670 aa  345  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.71 
 
 
583 aa  341  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.86 
 
 
581 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  37.69 
 
 
839 aa  333  8e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  35.91 
 
 
653 aa  330  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.39 
 
 
702 aa  329  7e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.35 
 
 
716 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.45 
 
 
677 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.78 
 
 
655 aa  301  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3069  peptidoglycan glycosyltransferase  36.42 
 
 
586 aa  296  9e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0109625  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.91 
 
 
754 aa  295  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1656  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.81 
 
 
682 aa  294  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.06 
 
 
692 aa  292  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1564  peptidoglycan glycosyltransferase  34.42 
 
 
600 aa  291  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.924242  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.13 
 
 
618 aa  289  9e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  34.99 
 
 
716 aa  287  4e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1565  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.11 
 
 
600 aa  286  7e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16620  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.53 
 
 
663 aa  282  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.422305  normal  0.0185219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.58 
 
 
635 aa  276  7e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  34.17 
 
 
729 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  33.39 
 
 
582 aa  270  8.999999999999999e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2100  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.92 
 
 
568 aa  269  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000215244 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  33.9 
 
 
657 aa  268  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.39 
 
 
657 aa  264  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.38 
 
 
553 aa  263  4.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1068  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.92 
 
 
579 aa  263  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  31.06 
 
 
695 aa  259  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.91 
 
 
662 aa  256  7e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  33.61 
 
 
656 aa  256  8e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  33.8 
 
 
586 aa  252  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.11 
 
 
644 aa  251  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13660  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.64 
 
 
608 aa  252  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00924315  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  31.63 
 
 
657 aa  249  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.73 
 
 
595 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  31.28 
 
 
708 aa  248  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.89 
 
 
595 aa  248  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  31.88 
 
 
578 aa  248  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.53 
 
 
571 aa  247  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.06 
 
 
570 aa  248  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2416  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.61 
 
 
584 aa  247  4.9999999999999997e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.27 
 
 
588 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  34.02 
 
 
548 aa  247  6e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  34.02 
 
 
552 aa  246  6.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.55 
 
 
582 aa  245  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  34.44 
 
 
583 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  29.15 
 
 
705 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  34.79 
 
 
587 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  31.84 
 
 
587 aa  244  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  31.88 
 
 
583 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  33.28 
 
 
605 aa  243  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  33.39 
 
 
600 aa  243  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.57 
 
 
672 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.84 
 
 
654 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  33.62 
 
 
595 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  33 
 
 
577 aa  241  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 
673 aa  241  4e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  33.11 
 
 
577 aa  241  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  32.14 
 
 
682 aa  241  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  31.01 
 
 
740 aa  240  6.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0175  cell division protein  30.51 
 
 
600 aa  239  8e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  33.02 
 
 
579 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  31.26 
 
 
582 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  31.58 
 
 
711 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09550  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.11 
 
 
581 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.102088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  30.51 
 
 
580 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  33.21 
 
 
579 aa  237  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
580 aa  236  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  32.3 
 
 
614 aa  236  7e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  31.26 
 
 
582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 
577 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.9 
 
 
619 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  32.41 
 
 
657 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  32.87 
 
 
556 aa  234  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  34.31 
 
 
575 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  31.68 
 
 
660 aa  234  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  31.42 
 
 
578 aa  233  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  31.13 
 
 
579 aa  233  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  30.72 
 
 
578 aa  231  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  32.47 
 
 
583 aa  231  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  32.48 
 
 
616 aa  231  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.27 
 
 
582 aa  230  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  32.48 
 
 
615 aa  230  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  32.54 
 
 
614 aa  230  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  32.7 
 
 
610 aa  230  7e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  32.54 
 
 
614 aa  229  9e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  32.54 
 
 
614 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>