More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3023 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3273  peptidoglycan glycosyltransferase  58.13 
 
 		 642 aa  700    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709571  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 634 aa  1274    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  58.63 
 
 		 635 aa  711    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3262  peptidoglycan glycosyltransferase  58.13 
 
 		 642 aa  700    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258403  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2652  Peptidoglycan glycosyltransferase  56.77 
 
 		 654 aa  714    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  60.07 
 
 		 679 aa  717    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  58.13 
 
 		 642 aa  700    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  59.34 
 
 		 652 aa  710    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.42 
 
 		 635 aa  528  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  44.33 
 
 		 637 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3930  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.67 
 
 		 570 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000459011  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  38.32 
 
 		 638 aa  378  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  38.69 
 
 		 727 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.11 
 
 		 607 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.78 
 
 		 583 aa  349  7e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  38.2 
 
 		 581 aa  345  2e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.33 
 
 		 702 aa  333  5e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  37.44 
 
 		 670 aa  325  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  36.53 
 
 		 839 aa  317  6e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.57 
 
 		 754 aa  316  7e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.34 
 
 		 692 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  35.51 
 
 		 653 aa  313  6.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.52 
 
 		 655 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1656  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.97 
 
 		 682 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3069  peptidoglycan glycosyltransferase  36.5 
 
 		 586 aa  295  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0109625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.54 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.46 
 
 		 716 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.59 
 
 		 635 aa  276  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1565  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.03 
 
 		 600 aa  273  9e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.48 
 
 		 677 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2100  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.07 
 
 		 568 aa  271  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000215244 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  31.93 
 
 		 657 aa  270  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1068  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.34 
 
 		 579 aa  268  2.9999999999999995e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.42 
 
 		 657 aa  267  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16620  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.01 
 
 		 663 aa  266  7e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.422305  normal  0.0185219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  33.16 
 
 		 657 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  32.75 
 
 		 657 aa  265  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13660  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.66 
 
 		 608 aa  264  3e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00924315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  33.28 
 
 		 656 aa  264  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  34.62 
 
 		 716 aa  264  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2416  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.5 
 
 		 584 aa  264  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.82 
 
 		 618 aa  264  4e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1564  peptidoglycan glycosyltransferase  30.82 
 
 		 600 aa  262  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.924242  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  31.75 
 
 		 631 aa  260  5.0000000000000005e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.01 
 
 		 662 aa  259  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.42 
 
 		 654 aa  258  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  31.51 
 
 		 582 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.06 
 
 		 570 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  31.64 
 
 		 729 aa  254  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.49 
 
 		 644 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  32.03 
 
 		 579 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  31.86 
 
 		 579 aa  250  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  29.08 
 
 		 695 aa  248  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  32.56 
 
 		 660 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0175  cell division protein  30.66 
 
 		 600 aa  246  6e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.45 
 
 		 582 aa  246  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  30.96 
 
 		 578 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  31.54 
 
 		 624 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.14 
 
 		 582 aa  244  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.96 
 
 		 672 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  30.72 
 
 		 711 aa  242  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.07 
 
 		 619 aa  241  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09550  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.73 
 
 		 581 aa  241  4e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.102088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  31.4 
 
 		 583 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.25 
 
 		 621 aa  239  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  28.91 
 
 		 721 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  31.83 
 
 		 600 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  33.15 
 
 		 605 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  31.55 
 
 		 587 aa  238  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  31.26 
 
 		 579 aa  238  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  30.97 
 
 		 576 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  34.3 
 
 		 577 aa  238  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.78 
 
 		 645 aa  238  3e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  30.35 
 
 		 580 aa  237  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  31.6 
 
 		 675 aa  238  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  28.67 
 
 		 728 aa  237  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  31.15 
 
 		 582 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.79 
 
 		 571 aa  236  6e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  33.33 
 
 		 575 aa  236  7e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  30.89 
 
 		 582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  30.61 
 
 		 586 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0480  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.88 
 
 		 574 aa  236  1.0000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  31.4 
 
 		 583 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  31.56 
 
 		 621 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  29.22 
 
 		 727 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  31.58 
 
 		 690 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  31.15 
 
 		 582 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  31.72 
 
 		 575 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  31.04 
 
 		 614 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  33.7 
 
 		 556 aa  234  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  30.78 
 
 		 581 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  28.42 
 
 		 705 aa  233  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  31.61 
 
 		 607 aa  233  9e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  30.87 
 
 		 614 aa  233  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  30.87 
 
 		 614 aa  233  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  30.87 
 
 		 614 aa  233  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  30.87 
 
 		 614 aa  233  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  30.87 
 
 		 614 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  29 
 
 		 727 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  30.87 
 
 		 614 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>