More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3268 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 607 aa  1196    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  43.16 
 
 		 653 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.03 
 
 		 702 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.51 
 
 		 655 aa  422  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  42.81 
 
 		 727 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  41.54 
 
 		 638 aa  412  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.25 
 
 		 583 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  40.91 
 
 		 670 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  41.3 
 
 		 635 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  39.48 
 
 		 839 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3262  peptidoglycan glycosyltransferase  40.88 
 
 		 642 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3273  peptidoglycan glycosyltransferase  40.88 
 
 		 642 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709571  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.58 
 
 		 754 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  40.88 
 
 		 642 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  41.99 
 
 		 679 aa  372  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  40.31 
 
 		 652 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.11 
 
 		 634 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1656  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.3 
 
 		 682 aa  369  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.93 
 
 		 677 aa  365  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16620  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  40.63 
 
 		 663 aa  363  6e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.422305  normal  0.0185219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2652  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.5 
 
 		 654 aa  363  7.0000000000000005e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  38.28 
 
 		 637 aa  353  7e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3069  peptidoglycan glycosyltransferase  40.07 
 
 		 586 aa  352  8e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0109625  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.86 
 
 		 716 aa  349  8e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.97 
 
 		 635 aa  344  2.9999999999999997e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  38 
 
 		 581 aa  344  2.9999999999999997e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.39 
 
 		 692 aa  340  5e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3930  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.26 
 
 		 570 aa  338  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000459011  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  39.65 
 
 		 716 aa  334  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.96 
 
 		 553 aa  324  3e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.38 
 
 		 662 aa  323  8e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  35.75 
 
 		 708 aa  322  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.58 
 
 		 635 aa  320  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.55 
 
 		 644 aa  312  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1565  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.95 
 
 		 600 aa  310  5.9999999999999995e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.58 
 
 		 645 aa  306  7e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1564  peptidoglycan glycosyltransferase  35.17 
 
 		 600 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.924242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2100  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.35 
 
 		 568 aa  303  6.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000215244 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  34.39 
 
 		 656 aa  303  6.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.65 
 
 		 570 aa  303  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.37 
 
 		 582 aa  301  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1068  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.19 
 
 		 579 aa  298  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  34.88 
 
 		 729 aa  298  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  33.45 
 
 		 657 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.63 
 
 		 588 aa  295  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.67 
 
 		 618 aa  294  3e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09550  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.64 
 
 		 581 aa  292  1e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.102088 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  33.62 
 
 		 582 aa  291  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.62 
 
 		 582 aa  291  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  32.5 
 
 		 657 aa  291  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13660  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.35 
 
 		 608 aa  290  6e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00924315  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.02 
 
 		 619 aa  289  9e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  34.76 
 
 		 582 aa  288  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.98 
 
 		 595 aa  289  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.5 
 
 		 710 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.98 
 
 		 595 aa  287  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  34.52 
 
 		 594 aa  286  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  34.52 
 
 		 594 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  34.52 
 
 		 594 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  34.52 
 
 		 594 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  34.52 
 
 		 594 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  32.86 
 
 		 614 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  34.52 
 
 		 594 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  34.52 
 
 		 594 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.98 
 
 		 594 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  33.63 
 
 		 583 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  34.7 
 
 		 596 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  35.36 
 
 		 556 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 586 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  34.98 
 
 		 594 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  32.92 
 
 		 588 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  35.33 
 
 		 548 aa  284  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  32.92 
 
 		 588 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  32.92 
 
 		 588 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  32.92 
 
 		 588 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000490417 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  35.07 
 
 		 552 aa  284  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  32.92 
 
 		 588 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  32.68 
 
 		 631 aa  284  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  34.59 
 
 		 605 aa  283  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  32.91 
 
 		 578 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  32.58 
 
 		 614 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  31.01 
 
 		 695 aa  283  7.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  32.58 
 
 		 614 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  32.58 
 
 		 614 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  32.58 
 
 		 614 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  32.58 
 
 		 614 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  31.12 
 
 		 721 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  32.58 
 
 		 614 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.15 
 
 		 657 aa  283  8.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.57 
 
 		 704 aa  283  8.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  32.44 
 
 		 578 aa  282  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  33.63 
 
 		 583 aa  282  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  33.45 
 
 		 583 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0090  peptidoglycan synthetase FtsI  32.92 
 
 		 588 aa  281  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3516  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.75 
 
 		 588 aa  281  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0077  peptidoglycan synthetase FtsI  32.75 
 
 		 588 aa  281  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0092  peptidoglycan synthetase FtsI  32.75 
 
 		 588 aa  281  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.948544 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00084  hypothetical protein  32.75 
 
 		 588 aa  281  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  34.42 
 
 		 583 aa  281  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  33.45 
 
 		 583 aa  281  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>