More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2652 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2652  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 654 aa  1320    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  55.91 
 
 		 679 aa  677    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3273  peptidoglycan glycosyltransferase  57.54 
 
 		 642 aa  706    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709571  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  58.88 
 
 		 635 aa  705    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3262  peptidoglycan glycosyltransferase  57.54 
 
 		 642 aa  706    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258403  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  56.77 
 
 		 634 aa  706    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  57.54 
 
 		 642 aa  706    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  60.43 
 
 		 652 aa  717    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.01 
 
 		 635 aa  507  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  44.95 
 
 		 637 aa  502  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3930  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.15 
 
 		 570 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000459011  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.28 
 
 		 607 aa  355  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  35.59 
 
 		 638 aa  342  1e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  37.04 
 
 		 727 aa  339  8e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.31 
 
 		 583 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  35.09 
 
 		 839 aa  313  4.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  34.32 
 
 		 670 aa  309  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.96 
 
 		 581 aa  307  4.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.89 
 
 		 754 aa  302  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.5 
 
 		 702 aa  301  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  32.24 
 
 		 653 aa  298  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.78 
 
 		 655 aa  296  9e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.76 
 
 		 692 aa  291  3e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.66 
 
 		 716 aa  287  5e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  33.72 
 
 		 716 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1068  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.9 
 
 		 579 aa  273  5.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.27 
 
 		 553 aa  273  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2416  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.24 
 
 		 584 aa  273  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.72 
 
 		 618 aa  272  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1656  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.74 
 
 		 682 aa  272  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1564  peptidoglycan glycosyltransferase  32.03 
 
 		 600 aa  271  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.924242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1565  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.18 
 
 		 600 aa  270  7e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.45 
 
 		 677 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.65 
 
 		 657 aa  265  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2100  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.98 
 
 		 568 aa  263  6.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000215244 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13660  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.64 
 
 		 608 aa  263  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00924315  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16620  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.05 
 
 		 663 aa  258  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.422305  normal  0.0185219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  31.52 
 
 		 657 aa  258  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  30.88 
 
 		 657 aa  254  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  31.73 
 
 		 656 aa  254  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  30.41 
 
 		 657 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3069  peptidoglycan glycosyltransferase  32.78 
 
 		 586 aa  252  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0109625  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.03 
 
 		 571 aa  252  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  30.5 
 
 		 705 aa  251  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  31.4 
 
 		 582 aa  249  9e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  31.38 
 
 		 711 aa  248  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  32.88 
 
 		 607 aa  247  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.6 
 
 		 654 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.64 
 
 		 570 aa  246  9e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  31.05 
 
 		 587 aa  246  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  34 
 
 		 582 aa  245  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  30.86 
 
 		 622 aa  244  5e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  31.43 
 
 		 729 aa  243  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  32.8 
 
 		 601 aa  243  9e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  31.04 
 
 		 579 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  31.04 
 
 		 579 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  30.98 
 
 		 583 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  30.78 
 
 		 579 aa  241  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.99 
 
 		 662 aa  241  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.76 
 
 		 635 aa  241  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  31.39 
 
 		 583 aa  239  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  28.41 
 
 		 631 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  30.49 
 
 		 578 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  29.38 
 
 		 695 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  29.46 
 
 		 708 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  30.39 
 
 		 582 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  30.39 
 
 		 582 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  31.62 
 
 		 660 aa  233  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1107  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  29.49 
 
 		 613 aa  233  1e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  28.23 
 
 		 586 aa  232  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  30.33 
 
 		 597 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  31.6 
 
 		 614 aa  232  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  31.32 
 
 		 548 aa  231  3e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  31.32 
 
 		 552 aa  231  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  30.08 
 
 		 690 aa  231  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  33.85 
 
 		 575 aa  229  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.45 
 
 		 588 aa  229  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  32.91 
 
 		 577 aa  229  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  30.85 
 
 		 575 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.56 
 
 		 595 aa  229  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0175  cell division protein  29.84 
 
 		 600 aa  229  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  30.57 
 
 		 580 aa  228  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  30.73 
 
 		 585 aa  228  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  31.48 
 
 		 575 aa  227  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.23 
 
 		 595 aa  227  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  28.31 
 
 		 727 aa  226  7e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  30.49 
 
 		 576 aa  226  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  31.39 
 
 		 605 aa  226  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  27.62 
 
 		 713 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  31.19 
 
 		 578 aa  226  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.48 
 
 		 672 aa  224  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  31.73 
 
 		 673 aa  225  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  30.54 
 
 		 588 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0089  peptidoglycan synthetase FtsI  31.66 
 
 		 588 aa  224  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0090  peptidoglycan synthetase FtsI  31.66 
 
 		 588 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3516  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 		 588 aa  223  6e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0092  peptidoglycan synthetase FtsI  31.49 
 
 		 588 aa  223  6e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.948544 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0077  peptidoglycan synthetase FtsI  31.49 
 
 		 588 aa  223  6e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0086  peptidoglycan synthetase FtsI  31.49 
 
 		 588 aa  223  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.67693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3573  peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 		 588 aa  223  6e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>