More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3930 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3930  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 570 aa  1155    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000459011  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3273  peptidoglycan glycosyltransferase  41.09 
 
 		 642 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709571  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3262  peptidoglycan glycosyltransferase  41.09 
 
 		 642 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  41.09 
 
 		 642 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  40.75 
 
 		 635 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2652  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.15 
 
 		 654 aa  409  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  41.67 
 
 		 679 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  40.55 
 
 		 652 aa  405  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.77 
 
 		 634 aa  402  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.66 
 
 		 635 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.9 
 
 		 637 aa  388  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.18 
 
 		 607 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.69 
 
 		 702 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  36.05 
 
 		 727 aa  321  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  34.91 
 
 		 638 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.98 
 
 		 583 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  36.13 
 
 		 653 aa  298  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.68 
 
 		 655 aa  294  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  35.97 
 
 		 670 aa  290  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  35.73 
 
 		 839 aa  290  6e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1656  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.07 
 
 		 682 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  33.9 
 
 		 716 aa  274  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.6 
 
 		 677 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.5 
 
 		 692 aa  269  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.23 
 
 		 662 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.92 
 
 		 657 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.61 
 
 		 581 aa  260  4e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  32.8 
 
 		 614 aa  259  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2416  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.1 
 
 		 584 aa  258  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  33.27 
 
 		 582 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.51 
 
 		 582 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3069  peptidoglycan glycosyltransferase  32.8 
 
 		 586 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0109625  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  32.92 
 
 		 583 aa  252  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.21 
 
 		 553 aa  252  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 618 aa  251  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.03 
 
 		 716 aa  250  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.7 
 
 		 754 aa  250  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.17 
 
 		 588 aa  249  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  31.99 
 
 		 657 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.16 
 
 		 635 aa  248  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  34.23 
 
 		 587 aa  248  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  32.2 
 
 		 577 aa  247  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16620  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.43 
 
 		 663 aa  247  4.9999999999999997e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.422305  normal  0.0185219 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.79 
 
 		 571 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1068  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.9 
 
 		 579 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1565  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.73 
 
 		 600 aa  243  9e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1564  peptidoglycan glycosyltransferase  32.2 
 
 		 600 aa  243  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.924242  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  30.58 
 
 		 657 aa  242  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  31.74 
 
 		 622 aa  241  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  30.51 
 
 		 595 aa  239  9e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  31.79 
 
 		 656 aa  239  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  32.8 
 
 		 581 aa  238  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.29 
 
 		 654 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  31.28 
 
 		 605 aa  238  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  31.46 
 
 		 613 aa  237  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  31.08 
 
 		 578 aa  238  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  31.63 
 
 		 729 aa  237  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  31.46 
 
 		 613 aa  236  6e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  31.38 
 
 		 586 aa  236  7e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  32.35 
 
 		 660 aa  236  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  30.76 
 
 		 657 aa  236  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.31 
 
 		 595 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.95 
 
 		 595 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3554  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.98 
 
 		 569 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  29.78 
 
 		 631 aa  233  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  30.49 
 
 		 580 aa  233  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  32.04 
 
 		 570 aa  233  8.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  32.22 
 
 		 548 aa  233  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  31.06 
 
 		 607 aa  233  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  32.22 
 
 		 552 aa  232  1e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.94 
 
 		 594 aa  233  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  33.94 
 
 		 594 aa  233  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  31.38 
 
 		 579 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  32.35 
 
 		 575 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.85 
 
 		 708 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  31.38 
 
 		 579 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  29.14 
 
 		 705 aa  231  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  30.85 
 
 		 582 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  31.94 
 
 		 582 aa  229  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.94 
 
 		 582 aa  229  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  31.48 
 
 		 577 aa  228  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1250  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.01 
 
 		 592 aa  228  3e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0497738  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  31.3 
 
 		 578 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  32.26 
 
 		 615 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  31.16 
 
 		 578 aa  226  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  30.66 
 
 		 580 aa  226  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  32.44 
 
 		 615 aa  226  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  32.44 
 
 		 615 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  32.44 
 
 		 615 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  30.37 
 
 		 586 aa  225  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  32.44 
 
 		 615 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  31.48 
 
 		 576 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  32.09 
 
 		 615 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  30.74 
 
 		 587 aa  225  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.74 
 
 		 582 aa  224  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  31.35 
 
 		 583 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  31.31 
 
 		 614 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.38 
 
 		 614 aa  223  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  32.28 
 
 		 621 aa  223  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  32.04 
 
 		 616 aa  223  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>