More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12193 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3273  peptidoglycan glycosyltransferase  79 
 
 		 642 aa  1017    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709571  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2652  Peptidoglycan glycosyltransferase  55.91 
 
 		 654 aa  688    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3262  peptidoglycan glycosyltransferase  79 
 
 		 642 aa  1017    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258403  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  100 
 
 		 679 aa  1379    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  60.07 
 
 		 634 aa  714    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  79 
 
 		 642 aa  1017    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  78.65 
 
 		 652 aa  1001    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  79.06 
 
 		 635 aa  1010    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.57 
 
 		 635 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  46.24 
 
 		 637 aa  522  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3930  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.67 
 
 		 570 aa  411  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000459011  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  39.23 
 
 		 638 aa  372  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.43 
 
 		 607 aa  372  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  38.29 
 
 		 727 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  37.22 
 
 		 670 aa  342  1e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.9 
 
 		 702 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.35 
 
 		 581 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.08 
 
 		 583 aa  322  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  36.85 
 
 		 839 aa  322  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  34.56 
 
 		 653 aa  316  9e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.51 
 
 		 677 aa  311  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.03 
 
 		 716 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1656  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.62 
 
 		 682 aa  305  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.79 
 
 		 692 aa  293  7e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.8 
 
 		 754 aa  290  6e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.51 
 
 		 655 aa  289  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3069  peptidoglycan glycosyltransferase  35.39 
 
 		 586 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0109625  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.94 
 
 		 618 aa  283  8.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1565  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.22 
 
 		 600 aa  282  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  34.8 
 
 		 716 aa  281  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16620  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.55 
 
 		 663 aa  278  3e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.422305  normal  0.0185219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1564  peptidoglycan glycosyltransferase  32.71 
 
 		 600 aa  277  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.924242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2100  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.67 
 
 		 568 aa  274  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000215244 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.39 
 
 		 635 aa  265  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1068  Peptidoglycan glycosyltransferase  33 
 
 		 579 aa  263  4.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  32.72 
 
 		 656 aa  259  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  32.82 
 
 		 582 aa  258  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  32.75 
 
 		 657 aa  256  7e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.22 
 
 		 662 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.57 
 
 		 553 aa  256  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  32.58 
 
 		 587 aa  254  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.2 
 
 		 657 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  33.11 
 
 		 729 aa  253  6e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13660  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.94 
 
 		 608 aa  253  8.000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00924315  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  32.32 
 
 		 708 aa  253  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  29.95 
 
 		 695 aa  251  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.44 
 
 		 582 aa  251  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.94 
 
 		 654 aa  249  9e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  33.57 
 
 		 660 aa  249  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.91 
 
 		 672 aa  249  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0175  cell division protein  31.88 
 
 		 600 aa  248  2e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  34.77 
 
 		 548 aa  245  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  32.09 
 
 		 586 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  30.91 
 
 		 682 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  34.77 
 
 		 552 aa  244  3e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2416  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.94 
 
 		 584 aa  244  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  31.53 
 
 		 583 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.55 
 
 		 619 aa  241  2.9999999999999997e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  30.88 
 
 		 740 aa  241  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 		 578 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  32.14 
 
 		 614 aa  239  9e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.93 
 
 		 582 aa  239  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  30.6 
 
 		 657 aa  239  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  31.26 
 
 		 579 aa  238  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  31.92 
 
 		 657 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  31.09 
 
 		 579 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  31.09 
 
 		 580 aa  237  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  32.92 
 
 		 577 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  30.95 
 
 		 582 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  33.46 
 
 		 575 aa  234  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.48 
 
 		 571 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  30.59 
 
 		 711 aa  233  6e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1107  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  31.97 
 
 		 613 aa  233  6e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  30.95 
 
 		 582 aa  234  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  34.2 
 
 		 605 aa  233  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  31.59 
 
 		 585 aa  233  9e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  32.69 
 
 		 578 aa  232  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0480  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.49 
 
 		 574 aa  232  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  29.23 
 
 		 705 aa  232  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  31.67 
 
 		 577 aa  231  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.86 
 
 		 570 aa  231  5e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  30.76 
 
 		 583 aa  231  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  33.09 
 
 		 587 aa  229  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  31.31 
 
 		 553 aa  229  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  30.72 
 
 		 579 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.1 
 
 		 645 aa  229  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  30.98 
 
 		 576 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  30.98 
 
 		 575 aa  228  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  31.52 
 
 		 578 aa  227  7e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 		 595 aa  226  9e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2846  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 		 602 aa  226  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  31.36 
 
 		 673 aa  226  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2508  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.74 
 
 		 673 aa  225  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  31.87 
 
 		 583 aa  224  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  30.73 
 
 		 578 aa  224  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.89 
 
 		 588 aa  224  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.85 
 
 		 644 aa  224  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2899  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.46 
 
 		 680 aa  224  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0113727  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  31.7 
 
 		 583 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  31.7 
 
 		 583 aa  223  6e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>