More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1107 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1107  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  100 
 
 		 613 aa  1262    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0175  cell division protein  54.81 
 
 		 600 aa  703    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.42 
 
 		 618 aa  349  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.13 
 
 		 754 aa  343  8e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1068  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.99 
 
 		 579 aa  331  2e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1565  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.66 
 
 		 600 aa  315  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.93 
 
 		 692 aa  313  4.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1564  peptidoglycan glycosyltransferase  32.93 
 
 		 600 aa  313  4.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.924242  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  34.97 
 
 		 638 aa  307  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2416  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.55 
 
 		 584 aa  292  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.38 
 
 		 635 aa  291  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.68 
 
 		 581 aa  290  8e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  33.56 
 
 		 727 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  32.57 
 
 		 670 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2100  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 		 568 aa  270  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000215244 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13660  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.08 
 
 		 608 aa  267  4e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00924315  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.61 
 
 		 637 aa  265  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.16 
 
 		 583 aa  257  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3069  peptidoglycan glycosyltransferase  31.78 
 
 		 586 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0109625  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.59 
 
 		 702 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16620  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.37 
 
 		 663 aa  244  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.422305  normal  0.0185219 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  30.05 
 
 		 839 aa  244  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.56 
 
 		 607 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.05 
 
 		 655 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2652  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.49 
 
 		 654 aa  233  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  31.05 
 
 		 652 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  31.58 
 
 		 653 aa  232  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1656  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.21 
 
 		 682 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  31.97 
 
 		 679 aa  229  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  30.94 
 
 		 635 aa  225  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.46 
 
 		 634 aa  220  5e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.86 
 
 		 635 aa  217  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3273  peptidoglycan glycosyltransferase  29.44 
 
 		 642 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709571  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3262  peptidoglycan glycosyltransferase  29.44 
 
 		 642 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  29.44 
 
 		 642 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  28.5 
 
 		 695 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  29.6 
 
 		 656 aa  213  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.34 
 
 		 657 aa  213  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  30.4 
 
 		 583 aa  207  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.3 
 
 		 553 aa  207  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  30.05 
 
 		 708 aa  207  7e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.31 
 
 		 654 aa  206  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  30.07 
 
 		 583 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  30.07 
 
 		 583 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  30.07 
 
 		 583 aa  205  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  29.98 
 
 		 581 aa  205  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.32 
 
 		 716 aa  204  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.62 
 
 		 584 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  29.62 
 
 		 584 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  29.62 
 
 		 584 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  29.62 
 
 		 584 aa  203  7e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  29.37 
 
 		 578 aa  203  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  30.13 
 
 		 548 aa  203  8e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  28.64 
 
 		 657 aa  203  9e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  30.25 
 
 		 552 aa  202  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.92 
 
 		 582 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  29.45 
 
 		 578 aa  201  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  28.57 
 
 		 657 aa  201  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 		 583 aa  201  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  29.59 
 
 		 578 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3930  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.29 
 
 		 570 aa  198  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000459011  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  28.38 
 
 		 740 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  29.26 
 
 		 660 aa  195  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.59 
 
 		 677 aa  193  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  25.93 
 
 		 713 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3810  peptidoglycan glycosyltransferase  29.21 
 
 		 582 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  29.54 
 
 		 716 aa  190  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  28.69 
 
 		 578 aa  190  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  27.14 
 
 		 657 aa  190  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.86 
 
 		 662 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0755  peptidoglycan glycosyltransferase  30.73 
 
 		 587 aa  189  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  28.05 
 
 		 586 aa  189  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  27.94 
 
 		 673 aa  187  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  27.41 
 
 		 705 aa  187  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  28.19 
 
 		 594 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.19 
 
 		 594 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  29.06 
 
 		 610 aa  184  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  27.45 
 
 		 578 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.4 
 
 		 644 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  27.39 
 
 		 586 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1014  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.86 
 
 		 737 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1295  peptidoglycan synthetase FtsI  29.46 
 
 		 581 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2924  penicillin-binding protein 3  29.88 
 
 		 587 aa  181  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3393  penicillin-binding protein  29.88 
 
 		 587 aa  181  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3524  peptidoglycan glycosyltransferase  29.88 
 
 		 587 aa  181  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568102  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.36 
 
 		 588 aa  180  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1976  peptidoglycan synthetase FtsI  29.29 
 
 		 581 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0049201  normal  0.138464 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2037  peptidoglycan synthetase FtsI  29.29 
 
 		 581 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1980  peptidoglycan synthetase FtsI  29.29 
 
 		 581 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0756202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.23 
 
 		 645 aa  179  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  26.75 
 
 		 645 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3598  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.12 
 
 		 587 aa  178  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3786  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.07 
 
 		 587 aa  179  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  28.64 
 
 		 585 aa  178  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  29.38 
 
 		 553 aa  178  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0604  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.1 
 
 		 587 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0089  peptidoglycan synthetase FtsI  29.14 
 
 		 588 aa  177  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0086  peptidoglycan synthetase FtsI  29.14 
 
 		 588 aa  177  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.67693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3573  peptidoglycan glycosyltransferase  29.14 
 
 		 588 aa  177  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0077  peptidoglycan synthetase FtsI  29.14 
 
 		 588 aa  177  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>