More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1656 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1656  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
682 aa  1368    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  41.78 
 
 
727 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  43.59 
 
 
638 aa  444  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.3 
 
 
583 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.72 
 
 
702 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.97 
 
 
635 aa  405  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  42.58 
 
 
670 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  40.12 
 
 
653 aa  397  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.47 
 
 
754 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.37 
 
 
655 aa  378  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16620  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.74 
 
 
663 aa  375  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.422305  normal  0.0185219 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  41.12 
 
 
839 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.97 
 
 
607 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.82 
 
 
692 aa  355  1e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1068  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.54 
 
 
579 aa  351  2e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.73 
 
 
618 aa  349  8e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3069  peptidoglycan glycosyltransferase  38.36 
 
 
586 aa  342  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0109625  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.03 
 
 
581 aa  327  4.0000000000000003e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1565  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.43 
 
 
600 aa  319  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2416  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.88 
 
 
584 aa  315  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1564  peptidoglycan glycosyltransferase  34.19 
 
 
600 aa  309  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.924242  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.89 
 
 
716 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  37.58 
 
 
679 aa  298  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  35.82 
 
 
635 aa  297  5e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.16 
 
 
634 aa  297  5e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2100  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.18 
 
 
568 aa  296  9e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000215244 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  37.69 
 
 
716 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  34.75 
 
 
652 aa  295  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3262  peptidoglycan glycosyltransferase  35.05 
 
 
642 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3273  peptidoglycan glycosyltransferase  35.05 
 
 
642 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709571  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  35.05 
 
 
642 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.22 
 
 
677 aa  287  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2652  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.64 
 
 
654 aa  282  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.77 
 
 
637 aa  281  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3930  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.07 
 
 
570 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000459011  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  33.16 
 
 
657 aa  270  7e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.47 
 
 
662 aa  269  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0175  cell division protein  34.02 
 
 
600 aa  268  2e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.04 
 
 
654 aa  266  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.87 
 
 
635 aa  266  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  32.68 
 
 
656 aa  265  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  34.34 
 
 
552 aa  264  3e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  34.34 
 
 
548 aa  264  4e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  33.17 
 
 
587 aa  263  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.99 
 
 
657 aa  261  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
570 aa  261  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  32.63 
 
 
660 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.1 
 
 
594 aa  256  9e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  35.1 
 
 
594 aa  256  9e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  31.93 
 
 
596 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  30.68 
 
 
657 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  32.67 
 
 
578 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  34.06 
 
 
708 aa  254  5.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  31.75 
 
 
594 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  31.75 
 
 
594 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  31.75 
 
 
594 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  31.75 
 
 
594 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  31.75 
 
 
594 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  31.75 
 
 
594 aa  253  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  31.75 
 
 
594 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.61 
 
 
588 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  33.28 
 
 
580 aa  251  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.94 
 
 
582 aa  250  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.84 
 
 
703 aa  250  8e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  32.66 
 
 
577 aa  249  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.74 
 
 
595 aa  247  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  33.78 
 
 
581 aa  248  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  31.52 
 
 
586 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  32.61 
 
 
579 aa  247  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.52 
 
 
577 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.11 
 
 
582 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  33.11 
 
 
582 aa  246  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  33.33 
 
 
607 aa  246  9e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  31.58 
 
 
622 aa  246  9e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.25 
 
 
595 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  31.36 
 
 
657 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  33.62 
 
 
575 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  31.17 
 
 
631 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.88 
 
 
582 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  31.09 
 
 
630 aa  243  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  31.43 
 
 
719 aa  243  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  31.98 
 
 
595 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  31.94 
 
 
600 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  31.09 
 
 
630 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  32.05 
 
 
579 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  32.37 
 
 
578 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  32.7 
 
 
580 aa  242  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 
583 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  32.77 
 
 
580 aa  241  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  32.93 
 
 
587 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  31.07 
 
 
577 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  31.25 
 
 
632 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  31.25 
 
 
632 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  31.25 
 
 
632 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  31.48 
 
 
578 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.79 
 
 
619 aa  241  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  32.94 
 
 
729 aa  241  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  31.88 
 
 
579 aa  241  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.98 
 
 
644 aa  240  5.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  30.43 
 
 
618 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>