More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2508 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  52.71 
 
 		 680 aa  724    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2508  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 673 aa  1376    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2899  Peptidoglycan glycosyltransferase  66.62 
 
 		 680 aa  897    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0113727  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  66 
 
 		 673 aa  891    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0049  penicillin-binding protein 3  62.73 
 
 		 663 aa  845    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0588264  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  52.21 
 
 		 670 aa  684    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  69.99 
 
 		 684 aa  974    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  33.44 
 
 		 657 aa  343  5e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.3 
 
 		 654 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  34.53 
 
 		 660 aa  340  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.39 
 
 		 657 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 		 657 aa  328  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.84 
 
 		 662 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.92 
 
 		 689 aa  323  5e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  32.47 
 
 		 657 aa  318  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  31.31 
 
 		 656 aa  306  6e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.95 
 
 		 672 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  32.72 
 
 		 695 aa  301  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  32.38 
 
 		 711 aa  295  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  32.07 
 
 		 705 aa  295  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  31.57 
 
 		 713 aa  293  8e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.08 
 
 		 703 aa  291  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  32.63 
 
 		 644 aa  290  8e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  31.66 
 
 		 723 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  32.22 
 
 		 708 aa  281  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.39 
 
 		 588 aa  281  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  32.23 
 
 		 646 aa  280  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  31.77 
 
 		 586 aa  278  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  32.64 
 
 		 729 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  33.57 
 
 		 583 aa  278  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  34.05 
 
 		 585 aa  277  4e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  31.99 
 
 		 740 aa  277  5e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  29.58 
 
 		 682 aa  276  7e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.15 
 
 		 582 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.91 
 
 		 645 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3878  peptidoglycan glycosyltransferase  33.19 
 
 		 671 aa  274  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  34.29 
 
 		 727 aa  274  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  33.86 
 
 		 578 aa  275  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  31.54 
 
 		 631 aa  273  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  32.98 
 
 		 578 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  34.81 
 
 		 614 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  34.81 
 
 		 614 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  34.81 
 
 		 614 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  34.81 
 
 		 614 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  34.81 
 
 		 614 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  34.81 
 
 		 614 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  34.64 
 
 		 582 aa  269  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  32.7 
 
 		 675 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  32.22 
 
 		 618 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  31.1 
 
 		 721 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  30.8 
 
 		 728 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 		 632 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 		 632 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 		 632 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.46 
 
 		 571 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  34.63 
 
 		 614 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  33.92 
 
 		 614 aa  264  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 		 578 aa  265  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  33.28 
 
 		 595 aa  264  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.05 
 
 		 595 aa  264  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.05 
 
 		 595 aa  264  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  33.22 
 
 		 594 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  33.22 
 
 		 594 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  34.58 
 
 		 624 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  33.22 
 
 		 594 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  33.22 
 
 		 594 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  33.22 
 
 		 594 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  33.22 
 
 		 594 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.81 
 
 		 708 aa  263  4.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  32.69 
 
 		 586 aa  263  6e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  32.74 
 
 		 631 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  33.22 
 
 		 594 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  32.28 
 
 		 578 aa  262  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  33.63 
 
 		 621 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6002  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.74 
 
 		 577 aa  262  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358141  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  33.04 
 
 		 596 aa  261  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  31.7 
 
 		 587 aa  261  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.46 
 
 		 570 aa  261  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2238  peptidoglycan synthetase FtsI  32.74 
 
 		 577 aa  261  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  32.53 
 
 		 578 aa  261  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  34.31 
 
 		 622 aa  260  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 		 615 aa  260  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  32.74 
 
 		 630 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  33.98 
 
 		 615 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  31.28 
 
 		 649 aa  259  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  33.98 
 
 		 615 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 		 621 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  32.57 
 
 		 630 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.61 
 
 		 704 aa  258  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.69 
 
 		 583 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  32.95 
 
 		 615 aa  257  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  33.8 
 
 		 616 aa  256  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  33.8 
 
 		 615 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  32.36 
 
 		 578 aa  256  9e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3810  peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 		 582 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 		 610 aa  256  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  32.62 
 
 		 552 aa  255  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  34.33 
 
 		 577 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  32.62 
 
 		 548 aa  255  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  31.07 
 
 		 645 aa  255  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>