More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1250 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1250  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 592 aa  1159    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0497738  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  38.97 
 
 		 638 aa  323  6e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.35 
 
 		 702 aa  306  8.000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  35.83 
 
 		 670 aa  290  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  35.38 
 
 		 839 aa  276  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  34.14 
 
 		 653 aa  265  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.56 
 
 		 553 aa  262  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.17 
 
 		 635 aa  259  8e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.62 
 
 		 607 aa  257  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.09 
 
 		 692 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  34.85 
 
 		 727 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  37.82 
 
 		 716 aa  254  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.11 
 
 		 716 aa  253  9.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  31.02 
 
 		 657 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.09 
 
 		 655 aa  252  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.22 
 
 		 637 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.49 
 
 		 657 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.99 
 
 		 677 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  31.85 
 
 		 708 aa  243  9e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  33.9 
 
 		 711 aa  242  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  32.96 
 
 		 656 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.75 
 
 		 582 aa  242  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.55 
 
 		 662 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.71 
 
 		 583 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 618 aa  237  6e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1068  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.66 
 
 		 579 aa  235  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  30.85 
 
 		 586 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.03 
 
 		 581 aa  231  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.9 
 
 		 689 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2895  peptidoglycan synthetase FtsI , putative  34.72 
 
 		 584 aa  231  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2515  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.72 
 
 		 584 aa  231  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.678179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  31.52 
 
 		 729 aa  230  7e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16620  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.73 
 
 		 663 aa  228  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.422305  normal  0.0185219 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3930  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.01 
 
 		 570 aa  228  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000459011  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  32.03 
 
 		 723 aa  227  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1656  Peptidoglycan glycosyltransferase  33 
 
 		 682 aa  226  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  31.23 
 
 		 631 aa  225  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  31.62 
 
 		 660 aa  225  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.78 
 
 		 654 aa  223  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1565  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.09 
 
 		 600 aa  222  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1564  peptidoglycan glycosyltransferase  30.47 
 
 		 600 aa  222  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.924242  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  29.7 
 
 		 605 aa  219  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  31.56 
 
 		 635 aa  219  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  28.52 
 
 		 695 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  30.05 
 
 		 652 aa  217  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 		 553 aa  216  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.53 
 
 		 634 aa  215  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  31.71 
 
 		 645 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  31.06 
 
 		 657 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  33.09 
 
 		 675 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.27 
 
 		 675 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  29.24 
 
 		 595 aa  213  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.87 
 
 		 635 aa  213  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.4 
 
 		 595 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  30.46 
 
 		 679 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3262  peptidoglycan glycosyltransferase  29.66 
 
 		 642 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3273  peptidoglycan glycosyltransferase  29.66 
 
 		 642 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709571  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  29.66 
 
 		 642 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  30.39 
 
 		 582 aa  211  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  31.89 
 
 		 556 aa  211  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.9 
 
 		 675 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.4 
 
 		 595 aa  210  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  28.34 
 
 		 719 aa  209  8e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  29.46 
 
 		 649 aa  208  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.15 
 
 		 704 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  29.98 
 
 		 705 aa  208  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  30.13 
 
 		 649 aa  207  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  28.05 
 
 		 721 aa  207  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09550  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.37 
 
 		 581 aa  206  7e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.102088 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.02 
 
 		 582 aa  206  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  27.84 
 
 		 728 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3069  peptidoglycan glycosyltransferase  31.12 
 
 		 586 aa  205  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0109625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  29.24 
 
 		 582 aa  205  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  29.73 
 
 		 577 aa  204  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.67 
 
 		 570 aa  204  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  29.72 
 
 		 582 aa  203  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2652  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.67 
 
 		 654 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  32.22 
 
 		 570 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  28.42 
 
 		 657 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.22 
 
 		 594 aa  201  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  35.22 
 
 		 594 aa  201  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  30.94 
 
 		 682 aa  200  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  29.56 
 
 		 740 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.98 
 
 		 588 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.22 
 
 		 754 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0161  peptidoglycan glycosyltransferase  30.91 
 
 		 590 aa  197  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0480  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 574 aa  197  5.000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  29.57 
 
 		 596 aa  196  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  29.52 
 
 		 581 aa  196  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  28.28 
 
 		 607 aa  195  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.39 
 
 		 670 aa  195  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3955  peptidoglycan glycosyltransferase  28.69 
 
 		 603 aa  195  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.194154  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  28.48 
 
 		 577 aa  194  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1952  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.16 
 
 		 708 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0523217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1271  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.76 
 
 		 730 aa  194  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0816576  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.52 
 
 		 614 aa  194  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  29.76 
 
 		 594 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  29.76 
 
 		 594 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  29.76 
 
 		 594 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  29.76 
 
 		 594 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>