More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2515 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2895  peptidoglycan synthetase FtsI , putative  100 
 
 
584 aa  1195    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2515  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
584 aa  1195    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.678179  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.48 
 
 
594 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  49.48 
 
 
594 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  38.79 
 
 
552 aa  355  1e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  38.79 
 
 
548 aa  355  1e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.38 
 
 
570 aa  349  8e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  37.81 
 
 
553 aa  348  2e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  37.62 
 
 
553 aa  347  3e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  36.07 
 
 
575 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  36.09 
 
 
613 aa  338  9.999999999999999e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  35.91 
 
 
613 aa  336  9e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  36.27 
 
 
579 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  36.2 
 
 
622 aa  331  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  36.3 
 
 
586 aa  332  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.45 
 
 
614 aa  330  6e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0755  peptidoglycan glycosyltransferase  35.77 
 
 
587 aa  329  9e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  35.35 
 
 
579 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  36.07 
 
 
588 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3393  penicillin-binding protein  35.94 
 
 
587 aa  323  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  36.94 
 
 
570 aa  323  5e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2924  penicillin-binding protein 3  35.94 
 
 
587 aa  323  5e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  36.07 
 
 
588 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  36.07 
 
 
588 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3524  peptidoglycan glycosyltransferase  35.94 
 
 
587 aa  323  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568102  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  36.07 
 
 
588 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  36.07 
 
 
588 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000490417 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  35.35 
 
 
579 aa  323  6e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3786  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.77 
 
 
587 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 
584 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 
584 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  36.15 
 
 
583 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 
584 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 
584 aa  321  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  35.97 
 
 
585 aa  320  3.9999999999999996e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  35.69 
 
 
578 aa  320  5e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  34.68 
 
 
578 aa  320  5e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0089  peptidoglycan synthetase FtsI  36.3 
 
 
588 aa  320  6e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679095  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00085  transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 3)  36.3 
 
 
588 aa  319  7e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3516  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.3 
 
 
588 aa  319  7e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3573  peptidoglycan glycosyltransferase  36.3 
 
 
588 aa  319  7e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0077  peptidoglycan synthetase FtsI  36.3 
 
 
588 aa  319  7e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00084  hypothetical protein  36.3 
 
 
588 aa  319  7e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0086  peptidoglycan synthetase FtsI  36.3 
 
 
588 aa  319  7e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.67693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0092  peptidoglycan synthetase FtsI  36.3 
 
 
588 aa  319  7e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.948544 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0090  peptidoglycan synthetase FtsI  36.3 
 
 
588 aa  319  9e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.3 
 
 
588 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  33.94 
 
 
577 aa  318  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  34.24 
 
 
583 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  35.33 
 
 
578 aa  318  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  37.16 
 
 
570 aa  317  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  34.24 
 
 
583 aa  317  4e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  34.24 
 
 
583 aa  317  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  36.07 
 
 
583 aa  317  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  34.06 
 
 
583 aa  316  8e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  36.2 
 
 
582 aa  316  8e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 
583 aa  316  9e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  35.08 
 
 
578 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  37.23 
 
 
575 aa  315  9.999999999999999e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  36.01 
 
 
582 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.03 
 
 
595 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.96 
 
 
619 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  32.48 
 
 
595 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2968  penicillin-binding protein 3A  34.88 
 
 
565 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3598  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.23 
 
 
587 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35190  penicillin-binding protein 3A  34.7 
 
 
565 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  35.04 
 
 
614 aa  313  4.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0604  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.12 
 
 
587 aa  313  6.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2037  peptidoglycan synthetase FtsI  36.5 
 
 
581 aa  313  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00133127  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1976  peptidoglycan synthetase FtsI  36.5 
 
 
581 aa  313  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0049201  normal  0.138464 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1980  peptidoglycan synthetase FtsI  36.5 
 
 
581 aa  313  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0756202  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1295  peptidoglycan synthetase FtsI  36.5 
 
 
581 aa  313  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  34.55 
 
 
615 aa  312  9e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.85 
 
 
595 aa  312  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  34.28 
 
 
624 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  35.7 
 
 
578 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  34.29 
 
 
580 aa  312  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  33.97 
 
 
615 aa  312  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  34.73 
 
 
616 aa  312  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  34.53 
 
 
621 aa  312  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  34.73 
 
 
615 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  34.66 
 
 
578 aa  311  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  35.06 
 
 
582 aa  311  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.06 
 
 
582 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.71 
 
 
621 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  32.97 
 
 
581 aa  311  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  34.55 
 
 
615 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  34.55 
 
 
615 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  34.55 
 
 
615 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1479  peptidoglycan synthetase FtsI  36.31 
 
 
581 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0193532  normal  0.796051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  34.36 
 
 
578 aa  310  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.23 
 
 
571 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  34.12 
 
 
581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  35.35 
 
 
575 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0642  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.3 
 
 
587 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.407482  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  33.82 
 
 
580 aa  306  8.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  35.7 
 
 
578 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  33.09 
 
 
580 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  35.47 
 
 
580 aa  304  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  33.87 
 
 
597 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>