More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2476 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
649 aa  1329    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  41.33 
 
 
719 aa  491  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  42.72 
 
 
649 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  39.6 
 
 
695 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  37.67 
 
 
713 aa  445  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  38.56 
 
 
708 aa  440  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  39.82 
 
 
646 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  39.36 
 
 
644 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  39.03 
 
 
723 aa  435  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  36.95 
 
 
682 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  38.1 
 
 
734 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  36.76 
 
 
740 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  37.56 
 
 
645 aa  412  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  37.44 
 
 
711 aa  412  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3742  stage V sporulation protein D  37.61 
 
 
638 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  37 
 
 
638 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  37.16 
 
 
638 aa  405  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  37 
 
 
638 aa  403  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  36.91 
 
 
638 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  36.91 
 
 
638 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  36.75 
 
 
638 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  36.91 
 
 
638 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  37.16 
 
 
638 aa  405  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  37 
 
 
638 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3930  sporulation specific penicillin-binding protein  36.75 
 
 
638 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892193 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  35.77 
 
 
727 aa  399  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  35.92 
 
 
727 aa  395  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  35.25 
 
 
728 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  35.1 
 
 
721 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  34.68 
 
 
705 aa  385  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  36.07 
 
 
708 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1831  stage V sporulation protein D  33.68 
 
 
739 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  38.29 
 
 
553 aa  365  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2117  stage V sporulation protein D  33.63 
 
 
739 aa  363  6e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2477  peptidoglycan glycosyltransferase  36.83 
 
 
651 aa  360  6e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.686042  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.08 
 
 
704 aa  360  6e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  32.87 
 
 
657 aa  334  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.52 
 
 
662 aa  320  7.999999999999999e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.74 
 
 
657 aa  318  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.62 
 
 
582 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.85 
 
 
672 aa  304  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  30.59 
 
 
657 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  29.76 
 
 
656 aa  298  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  32.2 
 
 
657 aa  292  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.76 
 
 
654 aa  286  7e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  30.9 
 
 
729 aa  280  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1014  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.41 
 
 
737 aa  277  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  31.47 
 
 
660 aa  277  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  30.31 
 
 
586 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  32.93 
 
 
653 aa  274  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.52 
 
 
703 aa  273  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  32.65 
 
 
675 aa  272  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.47 
 
 
689 aa  272  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  33.5 
 
 
631 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1886  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.75 
 
 
736 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.99 
 
 
553 aa  265  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  30.72 
 
 
638 aa  264  4e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2634  penicillin-binding protein  30.49 
 
 
712 aa  259  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000396671 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.55 
 
 
645 aa  258  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  32.03 
 
 
727 aa  258  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  30.19 
 
 
670 aa  255  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2431  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  30.57 
 
 
712 aa  254  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00172457  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2566  peptidoglycan glycosyltransferase  30.7 
 
 
717 aa  254  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2392  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  31.08 
 
 
712 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311388  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2677  penicillin-binding protein  29.54 
 
 
712 aa  253  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2727  peptidoglycan glycosyltransferase  30.49 
 
 
684 aa  253  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2269  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.33 
 
 
680 aa  253  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2467  penicillin-binding protein  30.57 
 
 
712 aa  252  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00794581  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  32.32 
 
 
574 aa  252  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2648  penicillin-binding protein  30.57 
 
 
712 aa  252  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2666  penicillin-binding protein  30.57 
 
 
712 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  29.18 
 
 
589 aa  251  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.635287  normal  0.182989 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.48 
 
 
654 aa  249  9e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1172  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.52 
 
 
612 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1199  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.52 
 
 
612 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.69 
 
 
702 aa  249  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2717  penicillin-binding protein  29.86 
 
 
712 aa  248  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 
583 aa  247  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  30.66 
 
 
570 aa  247  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2679  penicillin-binding protein  29.5 
 
 
712 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314189  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  30.27 
 
 
839 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2488  peptidoglycan glycosyltransferase  30.21 
 
 
712 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00738321  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  28.79 
 
 
582 aa  243  5e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.62 
 
 
692 aa  243  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.34 
 
 
644 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3743  peptidoglycan glycosyltransferase  31.18 
 
 
699 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41017  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  28.48 
 
 
690 aa  240  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.12 
 
 
588 aa  239  9e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2116  peptidoglycan glycosyltransferase  27.77 
 
 
673 aa  239  9e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  28.76 
 
 
578 aa  239  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.33 
 
 
570 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3749  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.12 
 
 
607 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425103  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2528  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.6 
 
 
670 aa  239  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3969  penicillin-binding protein  30.57 
 
 
699 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00715296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3767  penicillin-binding protein  30.67 
 
 
716 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  31.25 
 
 
631 aa  237  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4055  penicillin-binding protein  30.67 
 
 
716 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  31.08 
 
 
632 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  31.08 
 
 
632 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  31.08 
 
 
632 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>