More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1498 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1498  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 556 aa  1101    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00439152  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.12 
 
 		 553 aa  354  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  38.14 
 
 		 727 aa  317  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.96 
 
 		 583 aa  312  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.16 
 
 		 702 aa  307  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  36.83 
 
 		 653 aa  296  4e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  38.18 
 
 		 708 aa  296  6e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.76 
 
 		 654 aa  289  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  33.79 
 
 		 586 aa  287  4e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.86 
 
 		 657 aa  286  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.79 
 
 		 655 aa  286  8e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.62 
 
 		 582 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.54 
 
 		 607 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.13 
 
 		 645 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  35.65 
 
 		 638 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  37.4 
 
 		 656 aa  283  9e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  35.54 
 
 		 657 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.55 
 
 		 662 aa  276  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.33 
 
 		 677 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.86 
 
 		 654 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  34.2 
 
 		 711 aa  271  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  33.91 
 
 		 740 aa  266  5e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  35.77 
 
 		 675 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  35.03 
 
 		 670 aa  266  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  33.27 
 
 		 657 aa  265  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.06 
 
 		 635 aa  262  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  31.49 
 
 		 721 aa  259  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  31.24 
 
 		 728 aa  259  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  34.56 
 
 		 705 aa  259  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  34 
 
 		 660 aa  257  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  32.35 
 
 		 719 aa  257  5e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  31.02 
 
 		 631 aa  257  5e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  34.53 
 
 		 578 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.13 
 
 		 584 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  34.13 
 
 		 584 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  34.13 
 
 		 584 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  34.13 
 
 		 584 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  34.23 
 
 		 583 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.02 
 
 		 644 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  33.72 
 
 		 690 aa  253  7e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  36.17 
 
 		 839 aa  252  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  31.39 
 
 		 657 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  31.69 
 
 		 553 aa  251  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  32.82 
 
 		 682 aa  251  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.81 
 
 		 637 aa  251  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  34.01 
 
 		 583 aa  251  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  31.81 
 
 		 713 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.76 
 
 		 710 aa  249  7e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  34.01 
 
 		 583 aa  249  7e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  34.01 
 
 		 583 aa  249  7e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  33.11 
 
 		 583 aa  249  8e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.63 
 
 		 704 aa  249  9e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3955  peptidoglycan glycosyltransferase  34.16 
 
 		 603 aa  247  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.194154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.85 
 
 		 672 aa  247  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  32.39 
 
 		 695 aa  246  6.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  33.27 
 
 		 708 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  33.98 
 
 		 644 aa  244  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3069  peptidoglycan glycosyltransferase  32 
 
 		 586 aa  243  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0109625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  32.7 
 
 		 646 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  34.65 
 
 		 577 aa  243  7e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  33.14 
 
 		 578 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.42 
 
 		 635 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.61 
 
 		 570 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  33.72 
 
 		 576 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.59 
 
 		 689 aa  240  5e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.71 
 
 		 618 aa  240  5.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  33.4 
 
 		 583 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  32.36 
 
 		 635 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  32.98 
 
 		 578 aa  239  8e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  33.92 
 
 		 575 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  35.15 
 
 		 729 aa  239  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  33.27 
 
 		 586 aa  239  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  36.75 
 
 		 716 aa  238  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0134  peptidoglycan glycosyltransferase  30.11 
 
 		 669 aa  237  4e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 578 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.82 
 
 		 692 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.69 
 
 		 703 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.93 
 
 		 716 aa  234  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  33.1 
 
 		 578 aa  234  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16620  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.48 
 
 		 663 aa  234  4.0000000000000004e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.422305  normal  0.0185219 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.7 
 
 		 634 aa  234  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4620  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.33 
 
 		 609 aa  233  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  31.51 
 
 		 583 aa  233  9e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.21 
 
 		 581 aa  233  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  31.53 
 
 		 580 aa  232  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09550  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.4 
 
 		 581 aa  232  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.102088 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  33.08 
 
 		 638 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.55 
 
 		 754 aa  232  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  32.8 
 
 		 578 aa  231  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2054  peptidoglycan synthetase FtsI  33.98 
 
 		 695 aa  231  3e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3273  peptidoglycan glycosyltransferase  32.01 
 
 		 642 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709571  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3262  peptidoglycan glycosyltransferase  32.01 
 
 		 642 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  32.01 
 
 		 642 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  30.77 
 
 		 582 aa  230  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  33.14 
 
 		 638 aa  230  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  32.04 
 
 		 587 aa  230  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  31.82 
 
 		 601 aa  230  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  32.83 
 
 		 649 aa  230  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  33.14 
 
 		 638 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  33.14 
 
 		 638 aa  230  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>