More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1831 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0544  stage V sporulation protein D  52.57 
 
 
721 aa  767    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6503  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2117  stage V sporulation protein D  97.12 
 
 
739 aa  1410    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2134  stage V sporulation protein D  56.61 
 
 
727 aa  813    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0528  stage V sporulation protein D  51.7 
 
 
728 aa  768    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1831  stage V sporulation protein D  100 
 
 
739 aa  1502    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1846  stage V sporulation protein D  56.59 
 
 
727 aa  810    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  38.23 
 
 
719 aa  488  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  38.9 
 
 
649 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  35.85 
 
 
708 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1298  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.62 
 
 
704 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  35.76 
 
 
695 aa  428  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  35.01 
 
 
711 aa  411  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  35.68 
 
 
723 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  33.69 
 
 
740 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  33.11 
 
 
713 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0478  penicillin-binding protein transpeptidase  35.19 
 
 
734 aa  389  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4016  sporulation specific penicillin-binding protein  35.78 
 
 
638 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.622695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1015  stage V sporulation protein D  35.01 
 
 
646 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  35.38 
 
 
644 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2565  stage V sporulation protein D  36.32 
 
 
638 aa  385  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.18233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3961  sporulation specific penicillin-binding protein  35.63 
 
 
638 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3766  sporulation specific penicillin-binding protein  35.78 
 
 
638 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3657  sporulation specific penicillin-binding protein  35.87 
 
 
638 aa  382  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3674  sporulation specific penicillin-binding protein  35.78 
 
 
638 aa  382  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4054  sporulation specific penicillin-binding protein  35.78 
 
 
638 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3968  sporulation specific penicillin-binding protein  35.63 
 
 
638 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313702  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1225  sporulation specific penicillin-binding protein  35.63 
 
 
638 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00126151  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3742  stage V sporulation protein D  35.63 
 
 
638 aa  382  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3930  sporulation specific penicillin-binding protein  35.78 
 
 
638 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00892193 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  31.54 
 
 
705 aa  379  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1048  stage V sporulation protein D  34.56 
 
 
708 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  33.53 
 
 
682 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  34.68 
 
 
645 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2476  peptidoglycan glycosyltransferase  33.68 
 
 
649 aa  369  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1112  peptidoglycan glycosyltransferase  37.24 
 
 
553 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0521932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.85 
 
 
672 aa  323  7e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  31.16 
 
 
657 aa  320  7.999999999999999e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.77 
 
 
662 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.96 
 
 
582 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  30 
 
 
657 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2477  peptidoglycan glycosyltransferase  33.71 
 
 
651 aa  300  6e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.686042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  31.16 
 
 
656 aa  298  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  30.29 
 
 
657 aa  296  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3635  peptidoglycan glycosyltransferase  29.07 
 
 
729 aa  294  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.12 
 
 
654 aa  288  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  30.19 
 
 
660 aa  287  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  31.38 
 
 
653 aa  283  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2706  Peptidoglycan glycosyltransferase  29 
 
 
689 aa  282  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0219846  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1271  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.95 
 
 
730 aa  280  8e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0816576  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  31.43 
 
 
638 aa  279  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  30.53 
 
 
586 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3743  peptidoglycan glycosyltransferase  32.21 
 
 
699 aa  272  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.41017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2566  peptidoglycan glycosyltransferase  31.35 
 
 
717 aa  269  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  31.05 
 
 
631 aa  269  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1014  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.65 
 
 
737 aa  264  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.75 
 
 
702 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  31.64 
 
 
670 aa  263  8e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3675  penicillin-binding protein  30.67 
 
 
716 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2488  peptidoglycan glycosyltransferase  29.91 
 
 
712 aa  263  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00738321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3658  penicillin-binding protein  30.81 
 
 
716 aa  262  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4017  penicillin-binding protein  30.68 
 
 
716 aa  262  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  31.74 
 
 
727 aa  262  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2679  penicillin-binding protein  29.77 
 
 
712 aa  261  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.314189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3962  penicillin-binding protein  30.4 
 
 
716 aa  261  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.81 
 
 
703 aa  260  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3767  penicillin-binding protein  30.67 
 
 
716 aa  260  8e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4055  penicillin-binding protein  30.67 
 
 
716 aa  260  8e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3931  penicillin-binding protein  30.54 
 
 
699 aa  260  8e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0456911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2677  penicillin-binding protein  29.63 
 
 
712 aa  259  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  29.85 
 
 
657 aa  259  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1224  penicillin-binding protein  30.54 
 
 
699 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0433521  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2634  penicillin-binding protein  30.6 
 
 
712 aa  257  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000396671 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1886  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.85 
 
 
736 aa  257  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3969  penicillin-binding protein  30.54 
 
 
699 aa  257  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00715296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2431  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  29.09 
 
 
712 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00172457  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.06 
 
 
644 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.65 
 
 
553 aa  255  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  31.67 
 
 
839 aa  254  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2666  penicillin-binding protein  28.96 
 
 
712 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149104 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2717  penicillin-binding protein  29.09 
 
 
712 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211599  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.7 
 
 
655 aa  251  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.22 
 
 
583 aa  250  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2467  penicillin-binding protein  28.82 
 
 
712 aa  250  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00794581  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2648  penicillin-binding protein  28.82 
 
 
712 aa  250  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.88 
 
 
692 aa  249  9e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  28.87 
 
 
690 aa  249  9e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  27.66 
 
 
675 aa  248  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2392  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  28.69 
 
 
712 aa  247  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311388  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1564  peptidoglycan glycosyltransferase  31 
 
 
600 aa  246  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.924242  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1207  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  27.72 
 
 
716 aa  243  7.999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.222588  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  29.34 
 
 
622 aa  241  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1789  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.13 
 
 
561 aa  242  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.816247  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1565  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.92 
 
 
600 aa  241  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.61 
 
 
654 aa  239  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3821  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.07 
 
 
675 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3765  peptidoglycan glycosyltransferase  28.07 
 
 
675 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.870412  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  29.17 
 
 
613 aa  234  3e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.52 
 
 
588 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3905  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.64 
 
 
675 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2846  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.38 
 
 
602 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>