More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2054 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2054  peptidoglycan synthetase FtsI  100 
 
 		 695 aa  1425    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2378  peptidoglycan glycosyltransferase  95.4 
 
 		 695 aa  1365    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0134  peptidoglycan glycosyltransferase  68.63 
 
 		 669 aa  949    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  38.5 
 
 		 587 aa  385  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.81 
 
 		 614 aa  375  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  38 
 
 		 622 aa  375  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  37.23 
 
 		 570 aa  372  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.65 
 
 		 619 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  36.26 
 
 		 583 aa  364  2e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  36.38 
 
 		 580 aa  364  3e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  39.24 
 
 		 587 aa  362  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  35.34 
 
 		 575 aa  359  7e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.64 
 
 		 570 aa  359  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  37.31 
 
 		 553 aa  357  3.9999999999999996e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  35.39 
 
 		 548 aa  355  1e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  35.39 
 
 		 552 aa  355  1e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  37.14 
 
 		 553 aa  355  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  36.75 
 
 		 570 aa  355  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  35.57 
 
 		 586 aa  355  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.82 
 
 		 571 aa  352  8.999999999999999e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  35.64 
 
 		 613 aa  351  3e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  36.33 
 
 		 578 aa  351  3e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  35.64 
 
 		 613 aa  350  4e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  37.09 
 
 		 585 aa  343  7e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  34.71 
 
 		 579 aa  339  8e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  34.56 
 
 		 582 aa  339  9e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  34.55 
 
 		 579 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1788  peptidoglycan synthetase FtsI  34.82 
 
 		 631 aa  337  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.399225 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  34.06 
 
 		 577 aa  337  5.999999999999999e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  34.52 
 
 		 578 aa  336  9e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  34.38 
 
 		 618 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  34.93 
 
 		 630 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  35.1 
 
 		 630 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.45 
 
 		 588 aa  335  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  35.06 
 
 		 568 aa  335  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4139  peptidoglycan glycosyltransferase  34.82 
 
 		 632 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261865  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3290  peptidoglycan glycosyltransferase  34.82 
 
 		 632 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4227  peptidoglycan glycosyltransferase  34.82 
 
 		 632 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  34.69 
 
 		 583 aa  332  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1197  penicillin-binding protein  35.05 
 
 		 596 aa  332  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113554  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1712  putative penicillin-binding protein  35.03 
 
 		 594 aa  331  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  35.11 
 
 		 624 aa  331  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  34.34 
 
 		 588 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  34.73 
 
 		 583 aa  330  6e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  34.34 
 
 		 588 aa  330  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  34.34 
 
 		 588 aa  330  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  34.34 
 
 		 588 aa  330  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  34.34 
 
 		 588 aa  330  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000490417 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  34.87 
 
 		 594 aa  330  7e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0373  penicillin-binding protein  34.87 
 
 		 594 aa  330  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  34.5 
 
 		 614 aa  330  7e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  34.87 
 
 		 594 aa  330  7e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  34.5 
 
 		 614 aa  330  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  34.5 
 
 		 614 aa  330  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  34.5 
 
 		 614 aa  330  7e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  34.5 
 
 		 614 aa  330  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  34.5 
 
 		 614 aa  330  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  34.5 
 
 		 614 aa  330  7e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1212  penicillin-binding protein  34.87 
 
 		 594 aa  330  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  35.15 
 
 		 621 aa  330  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1625  penicillin-binding protein  34.87 
 
 		 594 aa  329  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.142989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0213  penicillin-binding protein  34.87 
 
 		 594 aa  329  9e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  34.33 
 
 		 614 aa  329  9e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  34.4 
 
 		 583 aa  329  9e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  34.6 
 
 		 578 aa  329  9e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0089  peptidoglycan synthetase FtsI  34.18 
 
 		 588 aa  329  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  34.67 
 
 		 579 aa  329  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  35.74 
 
 		 575 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  34.4 
 
 		 583 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  34.4 
 
 		 583 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00085  transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 3)  34.18 
 
 		 588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3516  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.18 
 
 		 588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0086  peptidoglycan synthetase FtsI  34.18 
 
 		 588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.67693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00084  hypothetical protein  34.18 
 
 		 588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0090  peptidoglycan synthetase FtsI  34.18 
 
 		 588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  34 
 
 		 616 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0092  peptidoglycan synthetase FtsI  34.18 
 
 		 588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.948544 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0077  peptidoglycan synthetase FtsI  34.18 
 
 		 588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3573  peptidoglycan glycosyltransferase  34.18 
 
 		 588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3786  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.51 
 
 		 587 aa  328  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  33.94 
 
 		 615 aa  328  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  33.94 
 
 		 615 aa  328  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 		 582 aa  327  4.0000000000000003e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3598  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.57 
 
 		 587 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  34.05 
 
 		 615 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  33.94 
 
 		 615 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 		 595 aa  327  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.98 
 
 		 621 aa  327  6e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  33.33 
 
 		 582 aa  327  7e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 582 aa  326  8.000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  34.04 
 
 		 615 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  33.77 
 
 		 615 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 		 595 aa  326  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  33.17 
 
 		 577 aa  325  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  34.31 
 
 		 578 aa  323  5e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  34.35 
 
 		 610 aa  323  6e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.56 
 
 		 584 aa  323  8e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  33.56 
 
 		 584 aa  323  8e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  33.56 
 
 		 584 aa  323  8e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  33.56 
 
 		 584 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>