More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0134 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2054  peptidoglycan synthetase FtsI  68.63 
 
 		 695 aa  949    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2378  peptidoglycan glycosyltransferase  68.16 
 
 		 695 aa  939    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0134  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 669 aa  1379    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  40.13 
 
 		 587 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000128115 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  38.98 
 
 		 583 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.83 
 
 		 619 aa  394  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  39.5 
 
 		 570 aa  391  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  39.9 
 
 		 578 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  39.18 
 
 		 575 aa  388  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  38.51 
 
 		 580 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.79 
 
 		 614 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  37.61 
 
 		 548 aa  385  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  37.61 
 
 		 552 aa  385  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  38.77 
 
 		 622 aa  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  39.45 
 
 		 587 aa  381  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3393  penicillin-binding protein  38.59 
 
 		 587 aa  379  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2924  penicillin-binding protein 3  38.42 
 
 		 587 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3524  peptidoglycan glycosyltransferase  38.59 
 
 		 587 aa  379  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568102  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  37.8 
 
 		 613 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.75 
 
 		 570 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  37.97 
 
 		 613 aa  375  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  37.5 
 
 		 578 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00085  transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 3)  37.25 
 
 		 588 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3516  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.25 
 
 		 588 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0755  peptidoglycan glycosyltransferase  38.09 
 
 		 587 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00084  hypothetical protein  37.25 
 
 		 588 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  37.25 
 
 		 588 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000490417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  37.25 
 
 		 588 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0077  peptidoglycan synthetase FtsI  37.25 
 
 		 588 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0086  peptidoglycan synthetase FtsI  37.25 
 
 		 588 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.67693  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  37.25 
 
 		 588 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  36.44 
 
 		 570 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0092  peptidoglycan synthetase FtsI  37.25 
 
 		 588 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.948544 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3573  peptidoglycan glycosyltransferase  37.25 
 
 		 588 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  37.25 
 
 		 588 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  37.25 
 
 		 588 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0090  peptidoglycan synthetase FtsI  37.25 
 
 		 588 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3598  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.98 
 
 		 587 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.29 
 
 		 571 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0089  peptidoglycan synthetase FtsI  37.08 
 
 		 588 aa  368  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  37.19 
 
 		 586 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.42 
 
 		 582 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3786  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.09 
 
 		 587 aa  369  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  36.66 
 
 		 581 aa  365  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  36.44 
 
 		 582 aa  362  9e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  36.55 
 
 		 583 aa  362  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  37.71 
 
 		 575 aa  360  4e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  36.42 
 
 		 583 aa  359  9e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  37.2 
 
 		 585 aa  359  9.999999999999999e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  36.09 
 
 		 583 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  35.6 
 
 		 579 aa  357  3.9999999999999996e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0604  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.85 
 
 		 587 aa  356  6.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  36.09 
 
 		 583 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  36.09 
 
 		 583 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0630  peptidoglycan synthetase FtsI  37.39 
 
 		 588 aa  356  8.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  36.04 
 
 		 584 aa  356  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.04 
 
 		 584 aa  356  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  36.04 
 
 		 584 aa  356  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  36.04 
 
 		 584 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  36.26 
 
 		 578 aa  356  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  36.84 
 
 		 610 aa  356  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  35.81 
 
 		 578 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  35.54 
 
 		 582 aa  354  2.9999999999999997e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  36.78 
 
 		 553 aa  353  4e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  36.78 
 
 		 553 aa  353  7e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  34.9 
 
 		 579 aa  351  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  35.47 
 
 		 578 aa  350  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  34.95 
 
 		 581 aa  350  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  34.73 
 
 		 579 aa  350  5e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  35.62 
 
 		 568 aa  348  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0642  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.39 
 
 		 587 aa  347  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.407482  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  35.22 
 
 		 615 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.92 
 
 		 588 aa  345  2e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  33.61 
 
 		 580 aa  344  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  35.22 
 
 		 615 aa  344  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  35.22 
 
 		 615 aa  344  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  35.22 
 
 		 615 aa  344  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  35.11 
 
 		 580 aa  343  7e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  36.01 
 
 		 577 aa  343  8e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  34.89 
 
 		 615 aa  342  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  34.89 
 
 		 615 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3810  peptidoglycan glycosyltransferase  37.21 
 
 		 582 aa  342  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  35.45 
 
 		 582 aa  341  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  35.3 
 
 		 578 aa  342  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  34.89 
 
 		 616 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  35.27 
 
 		 621 aa  342  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.45 
 
 		 582 aa  341  2.9999999999999998e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.08 
 
 		 595 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.1 
 
 		 621 aa  340  7e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  34.8 
 
 		 577 aa  340  7e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  34.59 
 
 		 597 aa  339  8e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.08 
 
 		 595 aa  339  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  35.58 
 
 		 575 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  34.11 
 
 		 577 aa  338  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  35.02 
 
 		 582 aa  337  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  34.19 
 
 		 614 aa  337  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  33.87 
 
 		 614 aa  337  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  34.62 
 
 		 578 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  35.12 
 
 		 583 aa  336  7e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1295  peptidoglycan synthetase FtsI  34.62 
 
 		 581 aa  336  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>