76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4651 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4651  TonB family protein  100 
 
 
289 aa  559  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  37.64 
 
 
269 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  38.78 
 
 
279 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  35.96 
 
 
267 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  35.96 
 
 
267 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  33.22 
 
 
291 aa  99  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  33.33 
 
 
292 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  27.31 
 
 
267 aa  90.5  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  27.31 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  27.31 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  44.37 
 
 
266 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  31.34 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3695  TonB family protein  31.85 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4275  TonB family protein  36.9 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  37.93 
 
 
451 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  31.1 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  28.83 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  32.33 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  36.45 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  26.26 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  28.77 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  27.17 
 
 
258 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  37.84 
 
 
266 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  39.33 
 
 
154 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  41.25 
 
 
495 aa  58.9  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  40 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  29.2 
 
 
324 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  47.06 
 
 
411 aa  56.6  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  28.14 
 
 
279 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  30.33 
 
 
220 aa  56.2  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  33.7 
 
 
264 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  34.78 
 
 
265 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  32.61 
 
 
251 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  28.3 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  35.16 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3748  TonB family protein  40.45 
 
 
88 aa  52.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1668  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 
308 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  34.69 
 
 
308 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  32.95 
 
 
256 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  28.11 
 
 
248 aa  49.3  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  34.09 
 
 
219 aa  49.3  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1133  TonB family protein  33.71 
 
 
270 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  31.53 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  28.07 
 
 
248 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2307  TonB like protein  31.4 
 
 
263 aa  47  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.242598  normal  0.294418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1269  TonB protein  31.4 
 
 
263 aa  47  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111983  normal  0.123169 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  34.23 
 
 
296 aa  46.6  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  36.36 
 
 
278 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1614  TonB protein  27.21 
 
 
283 aa  45.8  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  35.38 
 
 
280 aa  46.2  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2822  TonB-like  37.25 
 
 
114 aa  46.2  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.628558  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  26.02 
 
 
269 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  26.8 
 
 
286 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1620  TonB family protein  38.04 
 
 
394 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.381372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  40.3 
 
 
164 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  35.51 
 
 
171 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  34.07 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  36.25 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  36.25 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  29.36 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  40.3 
 
 
202 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  29.63 
 
 
251 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  35.06 
 
 
317 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  36.36 
 
 
274 aa  43.9  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1517  TonB-like  26.73 
 
 
264 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  28.45 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  39.22 
 
 
265 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  30.77 
 
 
246 aa  43.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1616  TonB family protein  36.26 
 
 
378 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  hitchhiker  0.00492157 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1898  TonB family protein  36.26 
 
 
366 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  25.72 
 
 
264 aa  43.1  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  24.12 
 
 
2449 aa  43.1  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  24.88 
 
 
354 aa  42.7  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  29.91 
 
 
2136 aa  42.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82710  Inositol-1,4,5-triphosphate 5-phosphatase  34.67 
 
 
1118 aa  42.4  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0595728  normal  0.124532 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3297  TonB family protein  40.98 
 
 
470 aa  42  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158532  normal  0.575713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>