44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2854 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2854  TonB family protein  100 
 
 		 341 aa  674    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.145381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  43.14 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  41.18 
 
 		 495 aa  82.8  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  39.39 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  25.95 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  36.59 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  35.29 
 
 		 451 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  33.75 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  34.83 
 
 		 246 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  37.35 
 
 		 219 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  28.08 
 
 		 268 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0513  TonB-like  31.76 
 
 		 163 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1064  TonB family protein  41.18 
 
 		 180 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0992  TonB family protein  31.76 
 
 		 163 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0403121  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0952  TonB family protein  31.76 
 
 		 163 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3417  TonB protein  41.18 
 
 		 178 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2407  TonB family protein  44.44 
 
 		 343 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0852  TonB family protein  44.44 
 
 		 167 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0864  TonB family protein  44.44 
 
 		 142 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  27.03 
 
 		 2449 aa  49.3  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  27.4 
 
 		 268 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  26.39 
 
 		 268 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  25.93 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  30.99 
 
 		 248 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  31.25 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  28.35 
 
 		 266 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  33.64 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  30.68 
 
 		 269 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  34.38 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2528  TonB family protein  34.38 
 
 		 393 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  25.94 
 
 		 244 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  29.21 
 
 		 286 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  32.14 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  29.58 
 
 		 248 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  34.62 
 
 		 261 aa  43.5  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  38.98 
 
 		 267 aa  43.1  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  38.98 
 
 		 267 aa  43.1  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  28.74 
 
 		 294 aa  42.7  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  27.13 
 
 		 264 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  26.2 
 
 		 256 aa  42.7  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  27.47 
 
 		 258 aa  42.7  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  30.34 
 
 		 290 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2230  energy transducer  45.45 
 
 		 315 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52012  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0507  TonB family protein  34.72 
 
 		 272 aa  42.4  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00076316 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>