23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0808 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0808  TonB-like protein  100 
 
 		 217 aa  422  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.656217  hitchhiker  0.00924999 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0017  TonB-like  49.55 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0117  TonB family protein  43.78 
 
 		 215 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1338  TonB-like protein  45 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.101224 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0739  TonB-like  39.24 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  40.68 
 
 		 271 aa  52.4  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  28.27 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  37.93 
 
 		 292 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0458  hypothetical protein  27.17 
 
 		 319 aa  46.6  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154901  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  33.77 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  30.11 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  32.63 
 
 		 273 aa  45.1  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  32.47 
 
 		 441 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  36.21 
 
 		 292 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  41.07 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  29.81 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  29.09 
 
 		 2272 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6109  TonB family protein  51.35 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  38.46 
 
 		 286 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  30.77 
 
 		 2179 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  32.05 
 
 		 270 aa  42  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  34.67 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  35.09 
 
 		 219 aa  41.6  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>