12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0117 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0117  TonB family protein  100 
 
 		 215 aa  425  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0017  TonB-like  43.05 
 
 		 220 aa  146  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0808  TonB-like protein  41.47 
 
 		 217 aa  125  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.656217  hitchhiker  0.00924999 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0739  TonB-like  24.58 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1338  TonB-like protein  31.71 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.101224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  42.86 
 
 		 271 aa  51.6  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  32.5 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82710  Inositol-1,4,5-triphosphate 5-phosphatase  33.33 
 
 		 1118 aa  45.8  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0595728  normal  0.124532 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  37.25 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  30.93 
 
 		 295 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  36.54 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  47.5 
 
 		 972 aa  42.4  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>