40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2959 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2105  TonB domain-containing protein  100 
 
 
164 aa  334  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0973726  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2640  TonB domain-containing protein  100 
 
 
164 aa  334  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0807  TonB domain-containing protein  100 
 
 
164 aa  334  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22065  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2959  TonB domain-containing protein  100 
 
 
164 aa  334  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1972  TonB domain-containing protein  100 
 
 
164 aa  334  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.268921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3024  TonB domain-containing protein  99.39 
 
 
164 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3058  TonB domain-containing protein  99.39 
 
 
164 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1577  TonB domain-containing protein  92.07 
 
 
164 aa  263  8.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3417  TonB protein  62.75 
 
 
178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1064  TonB family protein  64.54 
 
 
180 aa  184  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381212  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2407  TonB family protein  64.23 
 
 
343 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0864  TonB family protein  57.75 
 
 
142 aa  167  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378576  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0952  TonB family protein  59.42 
 
 
163 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0513  TonB-like  58.7 
 
 
163 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0992  TonB family protein  58.7 
 
 
163 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0403121  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0852  TonB family protein  57.97 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0664  TonB protein  55.36 
 
 
170 aa  158  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0257163  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4095  TonB-like protein  60.87 
 
 
163 aa  148  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.134402  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1425  hypothetical protein  27.1 
 
 
169 aa  50.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  50 
 
 
354 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  34 
 
 
267 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  34 
 
 
267 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  33.33 
 
 
269 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  34.52 
 
 
291 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1657  TonB-like protein  43.48 
 
 
279 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  38.1 
 
 
267 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  38.1 
 
 
267 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  38.1 
 
 
267 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  43.48 
 
 
266 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1012  hypothetical protein  28.16 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.137866 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  44 
 
 
258 aa  43.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  38.46 
 
 
269 aa  42.4  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  34.52 
 
 
451 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  32.43 
 
 
330 aa  42.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  41.3 
 
 
265 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  39.58 
 
 
495 aa  41.6  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3924  hypothetical protein  28.12 
 
 
180 aa  40.8  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1428  hypothetical protein  27.18 
 
 
175 aa  40.8  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1636  hypothetical protein  28.43 
 
 
170 aa  40.8  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  39.53 
 
 
251 aa  40.8  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>