55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0243 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0243  TonB family protein  100 
 
 
333 aa  599  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  32.92 
 
 
318 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2216  TonB domain-containing protein  47.3 
 
 
316 aa  90.5  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  49.42 
 
 
925 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  30.16 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  29.84 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  33.96 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0469  TonB family protein  34.45 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  30.79 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  34.35 
 
 
342 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  31.56 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  27.71 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  33.03 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  33.17 
 
 
332 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  29.02 
 
 
318 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  43.48 
 
 
333 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  43.48 
 
 
333 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  25 
 
 
273 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  29.41 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  33.54 
 
 
290 aa  60.8  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  22.22 
 
 
271 aa  58.9  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  41.05 
 
 
318 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0535  protein TolA  31 
 
 
345 aa  54.7  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000935471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  48 
 
 
287 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.1 
 
 
561 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43680  predicted protein  42.42 
 
 
1458 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.16765  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  25.86 
 
 
2196 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  25.32 
 
 
346 aa  50.1  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  41.25 
 
 
303 aa  49.3  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  33.19 
 
 
351 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0860  protein TolA  37.7 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000165303  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 
657 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  25.69 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0726  TolA family protein  29.69 
 
 
304 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0649134  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2230  TonB family protein  37.5 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01563  protein TolA  25.16 
 
 
322 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.479302  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  26.96 
 
 
319 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  30.68 
 
 
278 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3120  protein TolA  26.39 
 
 
351 aa  47  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1444  hypothetical protein  33.09 
 
 
857 aa  46.2  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1632  hypothetical protein  49.15 
 
 
846 aa  45.8  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.790758 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  29.06 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3088  TonB family protein  62.96 
 
 
528 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0726849  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3033  TonB family protein  62.96 
 
 
528 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  28 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  27.8 
 
 
253 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  31.53 
 
 
347 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  34.9 
 
 
901 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0948  protein TolA  24.23 
 
 
346 aa  43.9  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.929529  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  34.12 
 
 
320 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  30 
 
 
342 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2318  Protein of unknown function DUF1626  33.8 
 
 
342 aa  43.5  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0252538 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2618  GUN4-like  36.02 
 
 
623 aa  43.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.0000189308  normal  0.347807 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  29.09 
 
 
342 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  32.71 
 
 
344 aa  42.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>