13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0746 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0746  TonB family protein  100 
 
 		 316 aa  640    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000019388  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0858  Fis family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.487763  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2162  transcriptional regulator, Fis family  43.22 
 
 		 298 aa  195  7e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.111868  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1909  hypothetical protein  36.31 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0613  TonB-like  35.44 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.543734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0749  transcriptional regulator, Fis family  31.03 
 
 		 285 aa  126  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0027337  normal  0.178173 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1712  hypothetical protein  30.07 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0852036  hitchhiker  0.00264543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  24.3 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  27.62 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3324  TonB family protein  29.29 
 
 		 258 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0714054  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2211  TonB family protein  22.56 
 
 		 274 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000585223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3539  TonB-like  29.19 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.08035e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0280  TonB domain-containing protein  30.26 
 
 		 341 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.256703  hitchhiker  0.000121849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>