47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0280 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0280  TonB domain-containing protein  100 
 
 		 341 aa  666    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.256703  hitchhiker  0.000121849 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2362  protein TolA  49.55 
 
 		 342 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.288809 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0860  protein TolA  39.39 
 
 		 323 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000165303  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2361  TonB family protein  55.14 
 
 		 163 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.264132 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3631  TonB-like  36.84 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.653756  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1586  TonB family protein  27.62 
 
 		 276 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0587  TonB family protein  31.78 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  51.19 
 
 		 1261 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  34.07 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0279  TonB family protein  37.93 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.219995  unclonable  0.00000796861 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  34.23 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  34.23 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  36.68 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0704  TonB family protein  30.6 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.149916  normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  37.35 
 
 		 268 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  50.72 
 
 		 444 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  25.47 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3324  TonB family protein  27.21 
 
 		 258 aa  53.9  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0714054  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  56.58 
 
 		 926 aa  53.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  70.83 
 
 		 501 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2976  putative TonB transport protein  31.25 
 
 		 289 aa  49.7  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  30 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  42.86 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1197 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  34.92 
 
 		 2449 aa  47.4  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  34.57 
 
 		 237 aa  47  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1487  TonB family protein  26.8 
 
 		 386 aa  46.6  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.39629 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  27.37 
 
 		 1088 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2211  TonB family protein  32.88 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000585223  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  57.78 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0694  TonB family protein  29.71 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335594  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0660  TonB-like protein  31.96 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0695  TonB family protein  29.71 
 
 		 256 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.773203  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  31.87 
 
 		 324 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  30.68 
 
 		 522 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  45.95 
 
 		 268 aa  43.9  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  33.73 
 
 		 273 aa  43.9  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  33.85 
 
 		 248 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0525  hypothetical protein  52 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  33.85 
 
 		 248 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000112  hypothetical protein  45.31 
 
 		 227 aa  43.1  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3015  TonB family protein  33.68 
 
 		 443 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  26.25 
 
 		 356 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  52.24 
 
 		 630 aa  43.1  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  53.62 
 
 		 423 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0138  TonB family protein  25 
 
 		 354 aa  42.7  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  31.58 
 
 		 296 aa  42.7  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>