68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1700 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  100 
 
 		 342 aa  652    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  34.63 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  30.28 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  39 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  30.75 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0469  TonB family protein  34.98 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  28.36 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  30.5 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1414  TonB, C-terminal  35.26 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1852  TonB-like protein  32.12 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3973  tolA protein  35.26 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0266991  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  32.99 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36650  TolA protein  35.65 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  31.48 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  29.7 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  32.18 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  29.37 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3994  protein TolA  38.3 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.513554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4197  protein TolA  36.84 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1250  Tol-Pal system, TolA  36.84 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.202899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  29.46 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1221  biopolymer transport protein TolA  35.79 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.882269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4403  TonB-like  37.89 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  28.3 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  29.26 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  42.25 
 
 		 925 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  27.75 
 
 		 1682 aa  53.9  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  27.69 
 
 		 304 aa  53.9  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  29.66 
 
 		 331 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  30.94 
 
 		 2196 aa  52.8  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  32.22 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  24.88 
 
 		 1088 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  24.86 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43680  predicted protein  32.81 
 
 		 1458 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.16765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  28.7 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  35.63 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  30.35 
 
 		 351 aa  50.4  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1586  TonB family protein  29.71 
 
 		 276 aa  50.1  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  33.94 
 
 		 3242 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  35.23 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  38.94 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  28.44 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  42.15 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  36.71 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  29.26 
 
 		 290 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3631  TonB-like  35.29 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.653756  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  26.79 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  36.71 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49618  predicted protein  40.44 
 
 		 958 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3120  protein TolA  29.03 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  38.94 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  38.94 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  32.62 
 
 		 651 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0243  TonB family protein  32.46 
 
 		 333 aa  47  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003914  TolA protein  29.79 
 
 		 354 aa  47  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0635795  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  35.53 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  26.55 
 
 		 220 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0948  protein TolA  25.51 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.929529  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  29.76 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  26.42 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3117  protein TolA  25.13 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0280  TonB domain-containing protein  30.34 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.256703  hitchhiker  0.000121849 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  29.79 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2340  hypothetical protein  29 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00623137  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  30.86 
 
 		 287 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  28.38 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  27.21 
 
 		 347 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  42.57 
 
 		 831 aa  43.1  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>