33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003914 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003914  TolA protein  100 
 
 		 354 aa  685    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0635795  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01609  hypothetical protein  76.42 
 
 		 342 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  65.16 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  46.37 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  36.13 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  35.11 
 
 		 328 aa  132  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  32.57 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  32.36 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  33.53 
 
 		 320 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  35.03 
 
 		 329 aa  106  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  39.58 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  33.62 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2087  hypothetical protein  35.05 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0261  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  31.61 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00647443  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  36.48 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  36.48 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  36.48 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  36.48 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2732  protein TolA  32.17 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00666488  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  30.84 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  29.72 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2532  TolA family protein  35.15 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000043804  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2441  TolA family protein  34.55 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000397376  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2369  TolA family protein  35.15 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000264795  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2749  tolA protein  36.02 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1526  TolA family protein  31.68 
 
 		 311 aa  54.7  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124316  normal  0.623667 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.06 
 
 		 561 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  22.33 
 
 		 1682 aa  46.2  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  30.34 
 
 		 342 aa  46.2  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  38.75 
 
 		 925 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  30.92 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1514  hypothetical protein  52.11 
 
 		 660 aa  43.5  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.767692  hitchhiker  0.00000248553 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1248  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  31.87 
 
 		 395 aa  43.5  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000169991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>