45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1461 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  100 
 
 		 320 aa  627  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  68.39 
 
 		 328 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  65.73 
 
 		 319 aa  334  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  60.35 
 
 		 341 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  68.44 
 
 		 311 aa  330  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  59.94 
 
 		 340 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  59.65 
 
 		 340 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  59.59 
 
 		 342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  61.63 
 
 		 329 aa  309  5e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2532  TolA family protein  59.94 
 
 		 340 aa  301  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000043804  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2441  TolA family protein  59.94 
 
 		 340 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000397376  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2369  TolA family protein  59.65 
 
 		 340 aa  299  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000264795  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2749  tolA protein  56.77 
 
 		 345 aa  289  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2732  protein TolA  61.83 
 
 		 309 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00666488  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  43.49 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2087  hypothetical protein  72.32 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1526  TolA family protein  75.86 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124316  normal  0.623667 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  43.99 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  36.09 
 
 		 293 aa  135  9e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  30.94 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  29.75 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  30.67 
 
 		 332 aa  86.3  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0726  TolA family protein  35.16 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0649134  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  30.67 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003914  TolA protein  32.54 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0635795  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  25.64 
 
 		 271 aa  58.9  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  30.86 
 
 		 273 aa  57  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1278  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  36.9 
 
 		 412 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000166753  hitchhiker  0.0000389021 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1155  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  34.48 
 
 		 389 aa  53.1  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2903  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  32.18 
 
 		 399 aa  49.7  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0261  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  27.16 
 
 		 351 aa  48.5  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00647443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2049  colicin uptake-like protein  32.18 
 
 		 146 aa  47  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0843  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.95 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0151621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0783  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.95 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209299  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0854  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1242 aa  45.1  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.814929  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0874  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.95 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal  0.358467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0810  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.95 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144537  normal  0.789068 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  24.06 
 
 		 1682 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0661  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.68 
 
 		 395 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498099  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0762  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.68 
 
 		 426 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000171784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2916  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.68 
 
 		 423 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000145417  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  35.05 
 
 		 725 aa  43.5  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01609  hypothetical protein  33.94 
 
 		 342 aa  43.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  34.91 
 
 		 925 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1088  hypothetical protein  32.08 
 
 		 122 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>