51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1897 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  100 
 
 		 335 aa  651    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  42.82 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01609  hypothetical protein  47.38 
 
 		 342 aa  199  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  32.06 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  32.74 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  35 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  31.86 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  34.4 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003914  TolA protein  54.72 
 
 		 354 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0635795  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  30.09 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  45.05 
 
 		 341 aa  95.9  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2087  hypothetical protein  42.48 
 
 		 327 aa  90.9  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1526  TolA family protein  43.88 
 
 		 311 aa  89.7  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124316  normal  0.623667 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2441  TolA family protein  42.86 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000397376  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2532  TolA family protein  42.86 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000043804  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  42.86 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  42.86 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  42.86 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2369  TolA family protein  41.76 
 
 		 340 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000264795  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2749  tolA protein  41.76 
 
 		 345 aa  85.9  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0726  TolA family protein  37.12 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0649134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  36.25 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  33.61 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  28.62 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0261  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  29.43 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00647443  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  27.67 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2732  protein TolA  31.62 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00666488  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1237  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.77 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0261791  normal  0.0695422 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2049  colicin uptake-like protein  31.63 
 
 		 146 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1278  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  31.53 
 
 		 412 aa  53.1  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000166753  hitchhiker  0.0000389021 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  25.07 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1396  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  33.88 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000130996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2957  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  33.88 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0300934  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2869  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  33.88 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000082663  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  28.72 
 
 		 1682 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0768  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  26.5 
 
 		 432 aa  47  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263681  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00699  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  26.5 
 
 		 421 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00012175  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00688  hypothetical protein  26.5 
 
 		 421 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000128446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2896  protein TolA  26.5 
 
 		 421 aa  47  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000491333  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0661  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  26.5 
 
 		 395 aa  47  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498099  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0762  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  26.5 
 
 		 426 aa  47  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000171784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2916  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  26.5 
 
 		 423 aa  47  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000145417  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0792  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  26.5 
 
 		 421 aa  47  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000022577  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0842  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  26.5 
 
 		 424 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0810  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  34.72 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144537  normal  0.789068 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0874  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  34.72 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal  0.358467 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0783  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  34.72 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0843  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  34.72 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0151621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  38.1 
 
 		 273 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  25.13 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1248  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  27.17 
 
 		 395 aa  43.1  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000169991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>