44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0843 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0843  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  100 
 
 		 392 aa  727    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0151621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0783  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  99.49 
 
 		 392 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209299  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0874  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  99.23 
 
 		 392 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal  0.358467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0810  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  99.23 
 
 		 392 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144537  normal  0.789068 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0842  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  79.7 
 
 		 424 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000389137  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2896  protein TolA  81.25 
 
 		 421 aa  186  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000491333  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00699  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  81.25 
 
 		 421 aa  186  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00012175  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2916  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  81.25 
 
 		 423 aa  186  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000145417  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0768  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  81.25 
 
 		 432 aa  186  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0792  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  81.25 
 
 		 421 aa  186  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000022577  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0762  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  81.25 
 
 		 426 aa  186  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000171784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0661  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  81.25 
 
 		 395 aa  186  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498099  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00688  hypothetical protein  81.25 
 
 		 421 aa  186  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000128446  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1237  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  82.03 
 
 		 406 aa  176  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0261791  normal  0.0695422 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1248  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  69.6 
 
 		 395 aa  143  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000169991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1278  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  64.1 
 
 		 412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000166753  hitchhiker  0.0000389021 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2869  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  65.67 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000082663  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1396  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  65.67 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000130996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2957  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  64.93 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0300934  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1155  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  61.27 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3088  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  69.6 
 
 		 386 aa  119  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00644238  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2049  colicin uptake-like protein  42.96 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2903  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  70.27 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0261  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.52 
 
 		 351 aa  99.8  8e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00647443  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  31.31 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  28.53 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  43.05 
 
 		 2196 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  39.77 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  36.49 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  36.49 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  36.49 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  36.49 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  27.84 
 
 		 925 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  30.95 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  27.78 
 
 		 319 aa  47  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  33.33 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  35.14 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  31.2 
 
 		 331 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44924  predicted protein  29.13 
 
 		 743 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2032  ribonuclease  37.69 
 
 		 1142 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.390229  normal  0.144876 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  34.51 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  41.38 
 
 		 894 aa  42.7  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  31.58 
 
 		 332 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>