40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1606 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  100 
 
 		 329 aa  639    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  84.12 
 
 		 340 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  83.82 
 
 		 340 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  83.04 
 
 		 342 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  80.94 
 
 		 341 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2369  TolA family protein  86.18 
 
 		 340 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000264795  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2441  TolA family protein  85.29 
 
 		 340 aa  455  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000397376  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2532  TolA family protein  85.88 
 
 		 340 aa  455  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000043804  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2749  tolA protein  81.74 
 
 		 345 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  66.47 
 
 		 328 aa  363  3e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  66.57 
 
 		 319 aa  352  7e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  65.65 
 
 		 311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  61.63 
 
 		 320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2732  protein TolA  56 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00666488  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  41.49 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2087  hypothetical protein  66.67 
 
 		 327 aa  165  8e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  38.61 
 
 		 304 aa  146  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1526  TolA family protein  64.04 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124316  normal  0.623667 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  36.28 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  33.64 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  34.26 
 
 		 356 aa  119  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0726  TolA family protein  36.84 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0649134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01609  hypothetical protein  31.66 
 
 		 342 aa  96.3  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  32.67 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  32.67 
 
 		 332 aa  87  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003914  TolA protein  37.87 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0635795  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  33.81 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  33.33 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0661  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  33.33 
 
 		 395 aa  53.9  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498099  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0261  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  31.3 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00647443  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1248  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  36.17 
 
 		 395 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000169991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2049  colicin uptake-like protein  29.2 
 
 		 146 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  25.15 
 
 		 1682 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  27.01 
 
 		 318 aa  47  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  33.82 
 
 		 925 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  29.81 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00803  Fibronectin type III domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G14620)  23.13 
 
 		 1066 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.154563 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2916  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  28.44 
 
 		 423 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000145417  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0842  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.51 
 
 		 424 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  31.55 
 
 		 331 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>