41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1856 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  100 
 
 		 319 aa  624  1e-178  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  83.7 
 
 		 311 aa  448  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  65.55 
 
 		 328 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1526  TolA family protein  77.12 
 
 		 311 aa  342  5e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124316  normal  0.623667 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  61.29 
 
 		 341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  61.18 
 
 		 340 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  60.88 
 
 		 340 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  60.82 
 
 		 342 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  66.26 
 
 		 329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2369  TolA family protein  62.94 
 
 		 340 aa  322  6e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000264795  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2441  TolA family protein  62.65 
 
 		 340 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000397376  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2532  TolA family protein  62.65 
 
 		 340 aa  320  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000043804  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  65.73 
 
 		 320 aa  318  6e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2732  protein TolA  74.68 
 
 		 309 aa  316  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00666488  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2749  tolA protein  58.55 
 
 		 345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  43.35 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  45.73 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2087  hypothetical protein  67.26 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  37.86 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  32.75 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  31.42 
 
 		 356 aa  116  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01609  hypothetical protein  34.14 
 
 		 342 aa  106  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  34.68 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0726  TolA family protein  36.92 
 
 		 304 aa  90.9  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0649134  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  34.68 
 
 		 332 aa  90.5  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003914  TolA protein  35.29 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0635795  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  32.14 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  32.11 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  29.65 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  34.01 
 
 		 318 aa  53.5  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2049  colicin uptake-like protein  35.63 
 
 		 146 aa  52.8  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0261  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  23.93 
 
 		 351 aa  49.7  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00647443  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  35.21 
 
 		 925 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  30.97 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1278  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  34.48 
 
 		 412 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000166753  hitchhiker  0.0000389021 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  30.58 
 
 		 2196 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2340  hypothetical protein  30.23 
 
 		 276 aa  43.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00623137  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  44.3 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  21.98 
 
 		 1682 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  41.94 
 
 		 332 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1092 aa  42.4  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>