34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1730 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  100 
 
 		 304 aa  600  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  43.21 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  38.6 
 
 		 328 aa  163  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  42.12 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  43.63 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  41.12 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  38.2 
 
 		 329 aa  142  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  31.2 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2732  protein TolA  35.9 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00666488  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  34.67 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  29.23 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  41.21 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  41.21 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  41.21 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  41.21 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  30.46 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003914  TolA protein  40.4 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0635795  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  31.1 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  30.74 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0726  TolA family protein  37.25 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0649134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2532  TolA family protein  38.99 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000043804  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2441  TolA family protein  38.99 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000397376  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2369  TolA family protein  38.99 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000264795  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01609  hypothetical protein  27.76 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  31.13 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2087  hypothetical protein  43.26 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1526  TolA family protein  39.29 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124316  normal  0.623667 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2749  tolA protein  37.7 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  28.4 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  27.53 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1248  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.19 
 
 		 395 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000169991  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  31.91 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2230  TonB family protein  28.41 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  25.96 
 
 		 1127 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>