55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1530 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  649    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  98.8 
 
 
332 aa  642    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  35.28 
 
 
271 aa  134  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  34.56 
 
 
273 aa  126  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  35.08 
 
 
298 aa  119  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  31.83 
 
 
328 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  32.26 
 
 
319 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  30.74 
 
 
304 aa  90.1  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  32.74 
 
 
311 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  31.45 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  29.36 
 
 
329 aa  79  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2087  hypothetical protein  39.29 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  27.27 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  35.54 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  28.37 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  30.61 
 
 
342 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  36.36 
 
 
318 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2193  Tol-Pal system TolA  32.23 
 
 
318 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00964226  normal  0.375599 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0535  protein TolA  37.97 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000935471  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  27.83 
 
 
253 aa  63.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1228  TolA protein, putative  37.84 
 
 
467 aa  63.2  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  36 
 
 
320 aa  63.2  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0243  TonB family protein  39.56 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  35.71 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2340  hypothetical protein  37 
 
 
276 aa  59.7  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00623137  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2230  TonB family protein  35.63 
 
 
308 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0469  TonB family protein  32.52 
 
 
335 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2216  TonB domain-containing protein  35.71 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3631  TonB-like  42.35 
 
 
332 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.653756  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1852  TonB-like protein  31.91 
 
 
366 aa  54.3  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  26.72 
 
 
356 aa  54.3  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  31.41 
 
 
340 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  31.41 
 
 
341 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  31.41 
 
 
340 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  31.41 
 
 
342 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  32.1 
 
 
282 aa  53.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2732  protein TolA  26.75 
 
 
309 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00666488  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1067  TolA protein  25.32 
 
 
346 aa  49.3  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.251769  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  38.67 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1414  TonB, C-terminal  31 
 
 
356 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.170707  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  31.65 
 
 
351 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3973  tolA protein  31 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0266991  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0948  protein TolA  30.47 
 
 
346 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.929529  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  31.71 
 
 
317 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  30.87 
 
 
253 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2461  protein TolA  26.44 
 
 
380 aa  46.2  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216675  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2211  TonB family protein  34.94 
 
 
274 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000585223  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  36.47 
 
 
925 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  23.86 
 
 
1682 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1248  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  28.89 
 
 
395 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000169991  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2162  transcriptional regulator, Fis family  32.29 
 
 
298 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.111868  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  33.85 
 
 
351 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3117  protein TolA  26.67 
 
 
309 aa  43.5  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  31.58 
 
 
275 aa  43.1  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1844  hypothetical protein  30.25 
 
 
911 aa  42.7  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00878784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>