28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1430 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  100 
 
 		 356 aa  687    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003914  TolA protein  65.16 
 
 		 354 aa  332  9e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0635795  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01609  hypothetical protein  63.28 
 
 		 342 aa  308  6.999999999999999e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  47.92 
 
 		 335 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  32.59 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  34.72 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  31.78 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  32.75 
 
 		 298 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  33.05 
 
 		 320 aa  107  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  34.35 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  41.62 
 
 		 293 aa  95.9  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  32.96 
 
 		 304 aa  87  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  35.59 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  35.59 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  35.59 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  35.59 
 
 		 341 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1526  TolA family protein  40 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124316  normal  0.623667 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2369  TolA family protein  39.13 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000264795  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2732  protein TolA  38.3 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00666488  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2532  TolA family protein  38.04 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000043804  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2441  TolA family protein  38.04 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000397376  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0261  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  28.98 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00647443  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2749  tolA protein  34.91 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  30.43 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1248  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.08 
 
 		 395 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000169991  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.36 
 
 		 561 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  29.63 
 
 		 332 aa  46.6  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1278  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  28.33 
 
 		 412 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000166753  hitchhiker  0.0000389021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>