50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1526 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1526  TolA family protein  100 
 
 		 311 aa  599  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124316  normal  0.623667 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  81.03 
 
 		 311 aa  425  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  76.8 
 
 		 319 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  62.2 
 
 		 328 aa  352  5e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  59.53 
 
 		 341 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  59.41 
 
 		 340 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  59.12 
 
 		 340 aa  325  7e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  65.94 
 
 		 320 aa  325  7e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  59.06 
 
 		 342 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  60.79 
 
 		 329 aa  310  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2369  TolA family protein  60 
 
 		 340 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000264795  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2441  TolA family protein  59.12 
 
 		 340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000397376  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2532  TolA family protein  59.71 
 
 		 340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000043804  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2749  tolA protein  56.52 
 
 		 345 aa  298  8e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2732  protein TolA  74.03 
 
 		 309 aa  296  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00666488  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2087  hypothetical protein  47.2 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  44.81 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  44.44 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  37.37 
 
 		 293 aa  132  7.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  32.34 
 
 		 356 aa  125  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  32.81 
 
 		 335 aa  116  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01609  hypothetical protein  34.94 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0726  TolA family protein  37.62 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0649134  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  35.21 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  34.03 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003914  TolA protein  33.72 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0635795  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  25.89 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  26.86 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0261  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  31 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00647443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2049  colicin uptake-like protein  35.63 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  28.21 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  37.36 
 
 		 925 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2230  TonB family protein  31.87 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2957  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.68 
 
 		 393 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0300934  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1396  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.68 
 
 		 388 aa  50.4  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000130996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2869  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.68 
 
 		 388 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000082663  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1248  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  32.65 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000169991  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  26.49 
 
 		 1682 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0842  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  31.67 
 
 		 424 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  35.42 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  35.42 
 
 		 2196 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00699  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  31.03 
 
 		 421 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00012175  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00688  hypothetical protein  31.03 
 
 		 421 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000128446  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0792  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  31.03 
 
 		 421 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000022577  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2896  protein TolA  31.03 
 
 		 421 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000491333  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0661  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  31.03 
 
 		 395 aa  43.5  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498099  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0762  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  31.03 
 
 		 426 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000171784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2916  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  31.03 
 
 		 423 aa  43.5  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000145417  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0768  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  31.03 
 
 		 432 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  31.34 
 
 		 331 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>