43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2892 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  100 
 
 		 296 aa  586  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  46.75 
 
 		 317 aa  219  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  43.1 
 
 		 337 aa  205  7e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  41.08 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  43.02 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  46.02 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  70.34 
 
 		 421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2263  protein TolA  60.34 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2773  TonB family protein  60.34 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2943  protein TolA  54.84 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  35.66 
 
 		 253 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  47.06 
 
 		 342 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  46.72 
 
 		 342 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  53.57 
 
 		 378 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  51.72 
 
 		 360 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  34.64 
 
 		 283 aa  92.4  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  32.84 
 
 		 345 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  38.14 
 
 		 344 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  41.76 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2586  protein TolA  42.27 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  40.7 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  44.71 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  44.71 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  44.71 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  44.71 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  44.71 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  44.71 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  44.71 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  44.71 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  43.68 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  41.18 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  41.18 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  41.18 
 
 		 351 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  42.02 
 
 		 351 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  41.67 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0695  protein TolA  42.24 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  33.33 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  28.25 
 
 		 290 aa  53.1  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0678  TolA family protein  35.85 
 
 		 355 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2715  TonB-like  44.07 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0316774  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3117  protein TolA  55.22 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  41.32 
 
 		 351 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3323  protein TolA  28.29 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.672074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>