35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2943 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2943  protein TolA  100 
 
 		 338 aa  647    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  43.73 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  41.49 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  42.23 
 
 		 317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  42.71 
 
 		 296 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  41.1 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  34.44 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  34.43 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2263  protein TolA  52.1 
 
 		 323 aa  105  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2773  TonB family protein  52.1 
 
 		 323 aa  105  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2461  protein TolA  55.95 
 
 		 380 aa  99.8  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  48.84 
 
 		 360 aa  97.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  47.27 
 
 		 342 aa  95.9  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  46.36 
 
 		 342 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  49.4 
 
 		 378 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  33.09 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  40.48 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  41.67 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  43.02 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  42.22 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  43.02 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  37.62 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3323  protein TolA  26.84 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.672074 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2715  TonB-like  50.85 
 
 		 353 aa  50.1  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0316774  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  33.33 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  33.33 
 
 		 351 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  40.74 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  40.74 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  40.74 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  40.74 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  40.74 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  40.74 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  40.74 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  40.74 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0587  TonB family protein  46 
 
 		 324 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>