51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2586 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2586  protein TolA  100 
 
 
350 aa  678    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807612  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  89.74 
 
 
351 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  88.89 
 
 
351 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  88.89 
 
 
351 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  89.17 
 
 
351 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0678  TolA family protein  78.93 
 
 
355 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0695  protein TolA  78.93 
 
 
355 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337402  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  67.83 
 
 
334 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  68.6 
 
 
341 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  68.6 
 
 
341 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  68.6 
 
 
341 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  68.6 
 
 
341 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  68.6 
 
 
341 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  68.6 
 
 
341 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  68.31 
 
 
341 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  53.04 
 
 
347 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  43.1 
 
 
360 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  61.42 
 
 
351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  57.72 
 
 
344 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  39.88 
 
 
345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  35.43 
 
 
296 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  33.42 
 
 
351 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  31.49 
 
 
317 aa  95.9  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  52.53 
 
 
342 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  52.53 
 
 
342 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  31.62 
 
 
302 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  30.77 
 
 
337 aa  90.9  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  52.38 
 
 
253 aa  89.7  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  34 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  39.13 
 
 
421 aa  79.7  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  45.3 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  41.86 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  40.91 
 
 
283 aa  65.1  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  28 
 
 
3242 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3117  protein TolA  28.8 
 
 
309 aa  52.8  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3631  TonB-like  29.87 
 
 
332 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.653756  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  43.64 
 
 
278 aa  50.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2773  TonB family protein  30.29 
 
 
323 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0587  TonB family protein  29.68 
 
 
324 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2263  protein TolA  30.29 
 
 
323 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0469  TonB family protein  25.73 
 
 
335 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2216  TonB domain-containing protein  40.62 
 
 
316 aa  46.6  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  52.94 
 
 
317 aa  46.6  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  35.8 
 
 
290 aa  46.2  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  29.01 
 
 
3392 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  35.1 
 
 
925 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  38.16 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  26.14 
 
 
332 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  33.33 
 
 
310 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  26.14 
 
 
332 aa  42.7  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  37.93 
 
 
320 aa  42.7  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>