50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0304 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  100 
 
 		 275 aa  542  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  83.04 
 
 		 283 aa  342  4e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  34.32 
 
 		 253 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  49.28 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  31.03 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  31.99 
 
 		 282 aa  98.6  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  33.84 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  50.57 
 
 		 378 aa  89.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  35.98 
 
 		 351 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  42.98 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2263  protein TolA  40.68 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2773  TonB family protein  40.68 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  35 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2586  protein TolA  42.42 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2461  protein TolA  44.05 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  34.29 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  37.9 
 
 		 351 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3117  protein TolA  38.18 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  44.19 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  34.68 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0678  TolA family protein  38.37 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  37.93 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  38.55 
 
 		 441 aa  57  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0695  protein TolA  29.13 
 
 		 355 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  30.7 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  30.7 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  30.7 
 
 		 351 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  34.12 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  31.52 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  35 
 
 		 341 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  35 
 
 		 341 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  35 
 
 		 341 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  35 
 
 		 341 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  35 
 
 		 341 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  35 
 
 		 341 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  35 
 
 		 341 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  32.43 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  32.22 
 
 		 342 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2230  TonB family protein  40 
 
 		 308 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  38.03 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  38.03 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1852  TonB-like protein  36 
 
 		 366 aa  46.2  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1586  TonB family protein  38.1 
 
 		 276 aa  45.8  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  31.58 
 
 		 332 aa  45.8  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2211  TonB family protein  34.72 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000585223  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1228  TolA protein, putative  26.19 
 
 		 467 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  33.71 
 
 		 332 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36650  TolA protein  28.57 
 
 		 452 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2216  TonB domain-containing protein  34.43 
 
 		 316 aa  42.7  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2530  LytB protein  28.57 
 
 		 253 aa  42.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000152154  normal  0.947452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>