44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0276 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  100 
 
 		 283 aa  549  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  81.27 
 
 		 275 aa  301  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  36.43 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  49.28 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  31.29 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  53.85 
 
 		 360 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  29.63 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  33.21 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  51.72 
 
 		 378 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  37.43 
 
 		 351 aa  89  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2263  protein TolA  42.5 
 
 		 323 aa  85.9  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2773  TonB family protein  42.5 
 
 		 323 aa  85.9  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  35 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2461  protein TolA  46.43 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  42.11 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  34.29 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  38.71 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3117  protein TolA  38.18 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  40.96 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  43.02 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0678  TolA family protein  30.53 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  35.48 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  36.84 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  31.06 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  31.06 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  31.06 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  38.04 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  40 
 
 		 341 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  40 
 
 		 341 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0695  protein TolA  30.53 
 
 		 355 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  35.51 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  40 
 
 		 341 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  40 
 
 		 341 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  40 
 
 		 341 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  40 
 
 		 341 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  40 
 
 		 341 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2586  protein TolA  35.63 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  40 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  33.33 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  31.58 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1852  TonB-like protein  34.67 
 
 		 366 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  33.71 
 
 		 332 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1228  TolA protein, putative  27.38 
 
 		 467 aa  43.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2230  TonB family protein  40 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>