39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2369 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2532  TolA family protein  99.41 
 
 		 340 aa  653    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000043804  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2441  TolA family protein  98.82 
 
 		 340 aa  649    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000397376  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2369  TolA family protein  100 
 
 		 340 aa  657    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000264795  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2539  protein TolA  87.65 
 
 		 340 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102859  hitchhiker  0.00000353705 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1741  Tol-Pal system TolA  87.35 
 
 		 340 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1745  TolA family protein  88.6 
 
 		 342 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000294178  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2749  tolA protein  88.41 
 
 		 345 aa  476  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1784  protein TolA  84.75 
 
 		 341 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000349437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  85.88 
 
 		 329 aa  461  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  62.57 
 
 		 328 aa  344  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  63.24 
 
 		 319 aa  343  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  62.35 
 
 		 311 aa  328  9e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  59.94 
 
 		 320 aa  296  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  39.22 
 
 		 298 aa  176  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2087  hypothetical protein  63.96 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1526  TolA family protein  63.16 
 
 		 311 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124316  normal  0.623667 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1730  putative tolA protein  38.49 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  36.89 
 
 		 293 aa  133  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  35 
 
 		 356 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  34.78 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2732  protein TolA  65.52 
 
 		 309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00666488  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003914  TolA protein  30.81 
 
 		 354 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0635795  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  37.29 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  36.96 
 
 		 332 aa  92.4  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0726  TolA family protein  42.22 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0649134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01609  hypothetical protein  29.43 
 
 		 342 aa  89.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  33.18 
 
 		 271 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  32.2 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1237  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  40.23 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0261791  normal  0.0695422 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0261  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  29.92 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00647443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2049  colicin uptake-like protein  32.18 
 
 		 146 aa  53.5  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1248  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  34.95 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000169991  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3756  hypothetical protein  20.14 
 
 		 1107 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  33.99 
 
 		 925 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  27.36 
 
 		 1682 aa  46.6  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  21.34 
 
 		 1111 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  20.87 
 
 		 1103 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  27.52 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1223  band 7 protein  31.75 
 
 		 507 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>