31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0261 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0261  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  100 
 
 		 351 aa  697    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00647443  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1237  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.77 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0261791  normal  0.0695422 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0842  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.7 
 
 		 424 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000389137  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2896  protein TolA  30.7 
 
 		 421 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000491333  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00688  hypothetical protein  30.7 
 
 		 421 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000128446  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0661  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.7 
 
 		 395 aa  62.8  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2916  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.7 
 
 		 423 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000145417  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0768  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.7 
 
 		 432 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0792  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.7 
 
 		 421 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000022577  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00699  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  30.7 
 
 		 421 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00012175  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  32.94 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2049  colicin uptake-like protein  33.33 
 
 		 146 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1897  TolA protein, membrane component  24.71 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2532  TolA family protein  30.38 
 
 		 340 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000043804  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2441  TolA family protein  30.38 
 
 		 340 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000397376  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  26.76 
 
 		 319 aa  53.1  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2749  tolA protein  30.38 
 
 		 345 aa  52.8  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2369  TolA family protein  30.38 
 
 		 340 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000264795  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2732  protein TolA  29.76 
 
 		 309 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00666488  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1526  TolA family protein  28.4 
 
 		 311 aa  51.2  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124316  normal  0.623667 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  30.38 
 
 		 329 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  26.49 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  27.16 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0762  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  34.71 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000171784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  27.16 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2565  Tol-Pal system TolA  27.16 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000197392  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003914  TolA protein  29.66 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0635795  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2957  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  28.05 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0300934  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1396  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  28.05 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000130996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2869  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  28.05 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000082663  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  27.33 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>