32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2340 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2340  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  526  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00623137  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  34.51 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  37.76 
 
 
332 aa  59.7  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  35.86 
 
 
875 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  37.76 
 
 
332 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  35.29 
 
 
2449 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  52.48 
 
 
484 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  28.92 
 
 
356 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0726  TolA family protein  39.13 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0649134  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  24.79 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  30.63 
 
 
351 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  31.5 
 
 
282 aa  52.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  30.32 
 
 
273 aa  52  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  45.76 
 
 
271 aa  50.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  27.32 
 
 
292 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  50 
 
 
489 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2732  protein TolA  31.03 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00666488  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02685  TolA-like protein  32.58 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00715679  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  24.65 
 
 
302 aa  47  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1700  TonB family protein  29 
 
 
342 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00909883  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  35 
 
 
283 aa  46.6  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  42.72 
 
 
444 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2315  hypothetical protein  34.78 
 
 
254 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2943  protein TolA  33.63 
 
 
338 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  37.14 
 
 
345 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  28.35 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1856  TolA family protein  31.87 
 
 
319 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0299684  normal  0.827846 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  31.15 
 
 
1888 aa  43.5  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1228  TolA protein, putative  34.43 
 
 
467 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0943  adhesion exoprotein  44.44 
 
 
979 aa  43.1  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  29.94 
 
 
219 aa  42.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1852  TonB-like protein  27.21 
 
 
366 aa  42.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>