43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3172 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  100 
 
 		 351 aa  684    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  49.32 
 
 		 356 aa  299  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  49.86 
 
 		 356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  50 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  50.28 
 
 		 356 aa  281  9e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3620  hypothetical protein  40.15 
 
 		 389 aa  239  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  39.74 
 
 		 379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3202  outer membrane protein  38.76 
 
 		 381 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4752  putative TolA  34.43 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  31.43 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2323  hypothetical protein  34.69 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0566369  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  27.75 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0670  hypothetical protein  34.15 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.121585  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  27.56 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6882  putative TonB protein  27.86 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3388  protein TolA  38.1 
 
 		 464 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.457375  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0685  TolA family protein  43.88 
 
 		 514 aa  75.9  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.134585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4148  putative TolA  34.59 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0745  protein TolA  35.94 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2718  hypothetical protein  32.56 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.822326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0972  CheA signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1310  protein TolA  34.35 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  26.79 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2366  TonB domain-containing protein  35.45 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.858133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4435  protein TolA  33.87 
 
 		 472 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2134  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  67  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1811  putative TolA  31.58 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33266  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5303  protein TolA  30.95 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.671035 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0561  hypothetical protein  30.52 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3201  putative signal peptide protein  33.96 
 
 		 148 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4761  protein TolA  29.37 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5228  protein TolA  29.37 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219448  normal  0.0816314 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1680  hypothetical protein  31.63 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  28.14 
 
 		 497 aa  59.7  0.00000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3245  hypothetical protein  30.53 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1901  hypothetical protein  30.3 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4788  hypothetical protein  29.13 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2429  hypothetical protein  27.78 
 
 		 287 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  28.19 
 
 		 1088 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  22.17 
 
 		 2449 aa  45.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  47.44 
 
 		 444 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  30.05 
 
 		 484 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1093  hypothetical protein  23.39 
 
 		 341 aa  42.7  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>