25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4148 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4148  putative TolA  100 
 
 		 325 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.347109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1811  putative TolA  84.05 
 
 		 320 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.33266  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  71.56 
 
 		 314 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1310  protein TolA  89.71 
 
 		 327 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6882  putative TonB protein  52.21 
 
 		 336 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4752  putative TolA  49.23 
 
 		 314 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2718  hypothetical protein  76.6 
 
 		 350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.822326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3057  putative TolA  32.34 
 
 		 317 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0784767  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  30.23 
 
 		 394 aa  97.8  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  32.95 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  33.05 
 
 		 436 aa  86.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  29.36 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  27.81 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2134  hypothetical protein  37.23 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2417  putative TolA  35.42 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0745  protein TolA  29.29 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2121  hypothetical protein  30.99 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859463  normal  0.381091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5303  protein TolA  28.81 
 
 		 458 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.671035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4761  protein TolA  29.66 
 
 		 471 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5228  protein TolA  29.66 
 
 		 471 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219448  normal  0.0816314 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  25.28 
 
 		 356 aa  49.3  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  26.21 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3497  outer membrane protein  25.73 
 
 		 379 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103237 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0392  hypothetical protein  33.33 
 
 		 368 aa  43.1  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3202  outer membrane protein  25.4 
 
 		 381 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>