22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0392 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0392  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  679    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1016  hypothetical protein  73.94 
 
 		 293 aa  219  7e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.751843  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2134  hypothetical protein  37.01 
 
 		 270 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5303  protein TolA  32.03 
 
 		 458 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.477296  normal  0.671035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4761  protein TolA  32.62 
 
 		 471 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5228  protein TolA  32.62 
 
 		 471 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.219448  normal  0.0816314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0745  protein TolA  33.04 
 
 		 450 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1217  TolA protein  28.98 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4435  protein TolA  30.48 
 
 		 472 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229247  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0329  hypothetical protein  31.03 
 
 		 273 aa  50.4  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.236548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3513  putative TolA  30.1 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613542  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3388  protein TolA  31.3 
 
 		 464 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.457375  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1640  tolA protein  25.23 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.639472  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  26.03 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  25.07 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3172  TolA, TolA protein  27.94 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00152494  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0921  TolA protein  26.21 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.214208 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  43.84 
 
 		 489 aa  43.5  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  38.66 
 
 		 407 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1698  tolA protein  25.24 
 
 		 356 aa  43.1  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42501  predicted protein  35.78 
 
 		 755 aa  43.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  30.72 
 
 		 916 aa  42.7  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>